秦可卿很神秘，不止是因为她神秘的身世和神秘的病情，还有她神秘的死亡。她究竟是怎么死的？是因病而死还是自缢而亡，始终是一个解释不清楚的谜。
在通行本红楼梦中，秦可卿虽然体现为得病而死，但也并未明确写明。王熙凤在梦中的秦可卿一番警示叮嘱之后，就传来了她的死讯。书中原文：
秦可卿具体是怎么死的，书中并没有写明。所以，秦可卿是如何死的存在争议。
很多人认为她并非病死，而另有他因。很多人认为她是自缢而死。证明秦可卿并非病死的直接证据，就是秦可卿判词中的图画。图画中画着高楼大厦，有一美人悬梁自尽。87版《红楼梦》电视剧中秦可卿就是在天香楼自缢而死的。
靖藏本红楼梦，第十三回有批注：秦可卿淫丧天香楼，作者用史笔也，老朽因其魂托凤姐贾家后事两件，岂是安富尊荣坐享人能想到者？其言其意，令人悲切感服，故赦之。因命芹溪删去“遗簪”、“更衣”诸文，是以此回只十页，删去“天香楼”一节，少去四五页也。
甲戌本红楼梦。第十三回前也有批注：隐去天香楼一节，是不忍下笔也。
靖藏本红楼梦第十三回，还有批语：可从此批，通回将可卿如何死故隐去，是余大发慈悲也。叹、叹！壬午季春，笏叟。
可见，我们现在看得通行本红楼梦是曾被删减过了的。可以肯定作者是写出了“遗簪”、“更衣”、“天香楼”等情节，最终因为不忍心而删去了。
“遗簪”、“更衣”，从字面看，尚且能理解意思，对事件内容有个大概理解。但“天香楼”一节，到底发生了什么？我们只能确定这是一个地方，至于发生什么事件，却不得而知。
但可以肯定的是，隐去的这些情节与秦可卿的死有关。正是“将可卿如何死故隐去”。想必“如何死故”就是秦可卿为何死和怎么死的意思。作者是故意将秦可卿死因隐去了。
