黑暗浮士德
奈克瑟斯奥特曼第14集，第15集，第16集，第18集，第24集——恶魔，恶梦，迷路，启示录，英雄（黑暗梅菲斯特篇）；黑暗梅菲斯特（沟吕木真也），是继黑暗浮士德之后的第二个黑暗巨人，也是黑暗浮士德的操作者同时也是奈克瑟斯（姫矢准）的死敌；他其实自身也是个人偶（背后是黑暗扎基），只不过相比黑暗浮士德，黑暗梅菲斯特是有自己的意识的，曾经奈克瑟斯的光也找过沟吕木真也，后因黑暗梅菲斯特自称是“沟吕木期待的自己”才使得沟吕木真也自愿与其合体。
黑暗梅菲斯特
奈克瑟斯奥特曼第32集——影（黑暗梅菲斯特二代）；黑暗梅菲斯特二代，人间体为记忆警察三泽广之，他被黑暗扎基引入黑暗后变身的黑暗巨人，和沟吕木变身的黑暗梅菲斯特有相同的能力，只不过他的眼睛会变成红色；后面奈克瑟斯（千树怜）不敌于他，后奈克瑟斯与取回人心的沟吕木变身所变成的黑暗梅菲斯特一代联手攻击他，后面沟吕木试图和黑暗梅菲斯特二代同归于尽才使得他被奈克瑟斯击败。
黑暗梅菲斯特二代
奈克瑟斯奥特曼第37集——纽带（黑暗扎基）；黑暗梅斯特的操作者，拥有强大的力量；起初是来访者以诺亚奥特曼为蓝本所制造出来的终极生物兵器，后来具备了自我意识而暴走，并且炸毁了来访者的星球；后来来到地球为了了解异生兽，后附身在人类科学家山冈一并以石堀光彦之名进入夜袭队，等待自己复活的时机。
黑暗扎基
梦比优斯奥特曼第35集——群青的光与影（伪剑（希卡利））；真身为巴巴尔星人（宇宙第一模仿者。也是假阿斯特拉与假欧布的变身者），试图变成剑（希卡利）的样子去破坏城市同时破坏希卡利在人类心目中的形象。
