千醉翁在酒楼遇到了前来喝酒的苏花子，两位醉拳宗师都有互相切磋之意，一番简单的寒暄之后，二人便动起手来。
千醉翁将螳螂拳的招式，与醉拳相结合。凭借一手独创的醉螳螂，千醉翁将苏花子打成重伤。在阿义的帮助下，受伤的苏花子逃离了酒楼。
为了救治苏花子的内伤，阿义前往药房抓药，结果回来的途中，遇到了一个睡在棺材里的怪人。
怪人调包了阿义的药，苏花子吃了这些药后，虽然治好了内伤，但却一直拉肚子。阿义推测是怪人在药里做了手脚，于是前去找他理论。
与怪人一番争执之后，阿义得知，怪人是苏花子的师弟药君。
得知苏花子被人打伤之后，药君将自己的绝技“探脉手”教给了阿义。而阿义将“醉拳”与“探脉手”结合，打败了千醉翁的“醉螳螂”，为苏花子报了仇。
这部《南北醉拳》的故事结构，和《醉拳》十分相似。都是父亲遭遇劲敌，儿子学习他人武功，为父亲报仇。
《醉拳》里，洪拳大师黄麒英遭遇强敌阎铁心，而他的儿子黄飞鸿学习醉拳，打败了阎铁心。这部《南北醉拳》里，苏花子败给了千醉翁，而他的干儿子阿义则学习“探脉手”，最终击败千醉翁。
“自家的功夫不如别家的好”，似乎也成为了袁和平“醉拳两部曲”里的统一主题。
