到1993年，侏罗纪公园已经基本可以投入使用，并准备向公众开放。为了平息投资者的担忧，哈蒙德聘请了古生物学家艾伦·格兰特博士、古植物学家埃莉·萨特勒博士和数学家伊恩·马尔科姆博士来参观并评估侏罗纪公园作为野生动物园的可行性。然而，其竞争对手基因公司BioSyn暗中收买了侏罗纪公园的程序员丹尼斯·内德利(韦恩·奈特饰)窃取恐龙胚胎。随后，恶劣的天气和人为的故意造成了一场灾难，摧毁了公园的电网，让恐龙得以逃离围场。
当恐龙占领努布拉岛时，格兰特博士和哈蒙德年幼的孙子莱克斯(阿里安娜·理查兹饰)和蒂姆(约瑟夫·马泽洛饰)被困在了丛林中。格兰特拯救了他们的生命，并及时返回侏罗纪公园的游客中心疏散了岛上的其他人。哈蒙德意识到他的侏罗纪公园梦想带来的灾难性后果，并决定永远关闭公园。
1993年后：哈蒙德和洛克哈特闹翻
本杰明·洛克伍德的女儿夏洛特和她的丈夫在努布拉尔岛坍塌后的一场车祸中丧生。失去亲人的洛克伍德决定在自己的庄园里使用克隆技术来再造自己的女儿。从《侏罗纪公园》事件中脱胎换骨的哈蒙德发现了洛克伍德的计划，并对他的搭档打算要做的“可怕的事情”感到十分愤怒。哈蒙德和洛克伍德为此闹翻了，本杰明·洛克伍德在洛克伍德庄园隐居。
1997年：《侏罗纪公园:失落的世界》
1997年，病重的约翰·哈蒙德濒临死亡，他的侄子彼得·勒德洛(阿利斯·霍华德饰)接替他担任InGen的CEO。哈蒙德邀请伊恩·马尔科姆加入一个团队前往索纳岛，记录那里的恐龙，这些恐龙在飓风后被放归到了野外。在饲养恐龙的B站点，马尔科姆得知勒德洛雇佣雇佣兵捕捉恐龙，他想把它们带回圣地亚哥侏罗纪公园的景点，这个公园是哈蒙德曾经放弃了的一个圆形动物园，当时他选择了努布拉尔岛。勒德洛的雇佣兵捕获了一只成年霸王龙和一只幼崽，准备将其送往美国。
载着这只霸王龙的船意外地撞向了码头，这只超级食肉动物被放出来在圣地亚哥横冲直撞。马尔科姆和莎拉·哈丁医生(朱丽安·摩尔饰)用这头幼霸王龙把成年霸王龙引诱回了码头，并把它封在船上。然后霸王龙被送回索尔纳岛。
1997-2001年：哈蒙德去世，Masrani Global收购InGen
到1998年约翰·哈蒙德去世时，他已经从一个寻求从克隆恐龙中获利的实业家和资本家变成了一个希望自己的成果永远被封闭在岛上的博物学家。同年，马斯拉尼全球公司（Masrani Global Corporation）的首席执行官西蒙·马斯拉尼(伊尔凡·汗)收购了InGen，目的是实现哈蒙德最初的梦想——在努布拉岛开设侏罗纪公园。
2001年：《侏罗纪公园3》
