很多人说《名侦探柯南》前期的剧集会比后面的剧情更加有表现力，无论是在剧情还是画面的渲染上都充满着悬疑氛围。比较明显的对比就是钢琴奏鸣曲《月光》*人事件重置的新旧两版，以前的画面颜色较暗，并且死者面目狰狞，有一种带入的紧张刺激感，但现在这些都被和谐，以至于没有少了原本的感觉。
很多观众也以此认为后期的柯南越来越偏向儿童动画，而最开始的柯南完完全全就是给大人看的。关于这点我也是这么认为的，但是最初的柯南有一次细节却深深地打了我的脸。
在《名侦探柯南》最开始的动画中是有明确的去主线剧情，以至于产生了很多不同的BUG。例如TV5《新干线大爆破事件》中将原本是琴酒和伏特加的戏份换成两个不相关的路人，导致这一集柯南窃听黑衣组织代号的关键信息被略过。
在TV 13《奇怪的寻亲*人事件》这一集其实是灰原哀的姐姐宫野明登场的重要主线剧情，但动画组还是将其进行魔改。让宫野明美加入的是一个跟黑衣组织毫不相关的机构，并且琴酒伏特加的戏份也完全删除。以至于后面灰原哀将要登场，剧情无法自圆其说，于是动画组自己原创了《黑衣组织十亿元抢劫事件》。
至于为什么动画组这么避讳出现黑衣组织的剧情，我查阅了相关资料并没有得到官方的说明。但在很多地方都说道，因为《名侦探肯纳》最初的动画设定为“低龄化”的定位，所以就将黑衣组织这个涉及到黑社会的剧情加以屏蔽，直到后来主线剧情越来越多，才重新加回来。
