林月如在游戏《仙剑二》的结局被救活，另外酒剑仙和圣姑也没有死，但电视剧已经让众人“英勇牺牲”，如果再给写活，估计会收到一众吐槽。
另外，在仙剑一游戏中王小虎是个八、九岁的孩子，而电视剧中王小虎却只比李逍遥小了几岁，《仙剑二》以王小虎为主人公展开，那时的王小虎长大成人，而李逍遥已经四十岁，根本就无法衔接，所以导演放弃《仙剑奇侠传二》，直接拍摄了《仙剑三》。
《仙剑三》虽然依然创造了很多经典，但因为时间线关系，也有很多雷人的穿帮剧情。
上海唐人制作公司为了衔接仙剑一和三的剧情，强行把李逍遥加入到《仙剑三》，景天是李三思的师傅，李三思是李逍遥的爹，李逍遥和景天同时出现，就很难自圆其说。
电视剧第一集中，李逍遥说300天后人间巨变，而景天到天界寻找灵珠的时间就超过了一年，前几集中雪见头发生长迅速，那时是春天，而最后一战的时间是在六月初六，这就已经过了一年半，对于游戏迷来说，时间上的逻辑就有些混乱尴尬了。
不过对于没有玩过游戏的影迷，茂山一斤肉换十斤粮食拯救苍生、龙葵二次跳入铸剑池、紫萱与长卿三世的爱感动了几代人的青春。
