事实证明，大量的岛屿给印度尼西亚带来的影响也是双面的。印度尼西亚的海岸线十分曲折，因此产生了众多优良的港湾，而海岸线以及港口都是发展国际贸易的重要条件。与此同时，这些岛屿也破坏了印度尼西亚的地缘结构。
印度尼西亚的国土面积呈现着东西狭长、南北分散的状态，这样的地理结构给印度尼西亚的经济发展带来了极大的阻碍。
印度尼西亚想要实现各个地区的联动必须修建完整的道路交通运输网，然而岛屿与岛屿之间的过长距离也让印度尼西亚承受着巨大的经济压力。
在交通通畅的情况下，苏门答腊岛运输到爪哇岛的货物要跋山涉水，长距离运输需要众多的事件，这也意味着货物运输的成本超乎人们的想象。
除了拥有破碎的地缘结构之外，印度尼西亚的陆地结构依旧带来了极大的困扰。印度尼西亚的核心是爪哇岛，拥有广阔的盆地，然而在印度尼西亚的其他地区，山地与丘陵占据了大部分的江山。
印度尼西亚地处热带地区，降水较高，森林茂密，内陆地区甚至被雨林覆盖。对于原本便不具备广阔的国土面积的印度尼西亚来说，这样的自然环境更是让他的发展雪上加霜。
目前印度尼西亚的森林覆盖率大概为67.8%，从生态的角度上来看这样的成绩十分喜人，然而只有迫切需要发展机遇的印度尼西亚人才能够体会到其中的痛苦。
对于印度尼西亚而言，农业发展机遇十分有限。一个国家想要发展农业必然有着
大片的平原，而印度尼西亚的山地和丘陵便是最大的阻碍。印度尼西亚海洋面积广大，平原面积却小到不值一提，加上国土面积破碎，大规模的农业发展对于印度尼西亚来说简直是天方夜谭。
印度尼西亚的地缘结构也阻碍了国家工业的发展。大规模的工厂的修建需要大片集中的土地，而印度尼西亚的土地山川与河流纵横交错，众多小面积的岛屿也无法形成统一的整体，这也就决定了印度尼西亚根本无法建设大型的产业链。
人们或许将希望寄托于拥有平原的爪哇岛的身上，然而只有13万平方公里的爪哇岛，如何能够承担起发展整个国家工业的重任呢?
印度尼西亚各个岛屿在地域上是相互隔绝的，在精神上的联系也并不紧密。换句话说，印度尼西亚其实是一个并不团结的国家。
1950年，印度尼西亚摆脱荷兰的统治实现了独立，此前众多岛屿各自为战，鲜少有交流的机会，这也导致了不同地域之间的人们是十分陌生的。
目前印度尼西亚已经以发展工业文明为手段建立了各个岛屿之间的联系，但是历史上形成的隔膜太大，印度尼西亚政府根本无法在短时间之内完全消除人们的消极情绪。
