本季的反派也继承自第一季。第一季的大Boss妖怪（Obake）被彻底消灭后，快餐小子、随意大厨、高压电犯罪舞者和蒸汽机男爵悉数亮相。
第一季中的反派黏黏怪在第二季跳白，成了超能陆战队的好伙伴，凭借其超能力多次扭转战局。尤其是对战负黏黏怪时，作用巨大。
本季也增加了可爱的新反派角色谜谜。
正义小伙伴也增加了临时帮手，一个超级大白，体型超级巨大的机器人。
最后一集中特里娜（Trina）是上一季妖怪（Obaka）的女儿，不知道第三季故事会向哪个方向发展。
第二季主要分前后两个部分。前半季主要关于西克拉斯公司的基因变异工程，西克拉斯公司领头人丽芙·阿玛拉（Liv Amara）为了研制新型药物拿自己做实验，结果病入膏肓，需要自己的克隆体找出拯救自己的办法。
丽芙·阿玛拉一路研制方法，不断催生各种怪物。
最终还是要依靠超能陆战队击败这些怪物，最终解救了丽芙·阿玛拉。
本季后半部分，超能陆战队有了自己的专属秘密基地。
一群小伙伴在里面研习技术，讨论行事策略，俨然一副超级英雄的样子。
与之相对应的是，警察局局长的女儿梅根·科鲁兹喜欢做记者，致力于找出超能陆战队真实身份。
剧中后半程设立一个这样的角色，和那些致力于找出匿名超级英雄的漫画角色一样，主要目的还是讨论这种义警对于城市的作用。
对于义警，《超能陆战队》给出的答案是，他们让城市变得更美好。
