如果单论《数码宝贝大冒险》与《神奇宝贝无印篇》这两部动画作品，尽管种种原因人气有着较大的差距，不过评价并非天壤之别。但是两个动画系列作品的影响力却差距大，虽然两个系列的第一部质量都极高，而且年代都很接近，可是两边从最初的策略就完全不同，动画出乎意料地获得成功后的道路、官方愿意倾斜给动画的资源也不同。
动画《神奇宝贝》从制作之初就已经在构思世界观和基础设定的问题，尤其是编剧首藤刚志一直在思考的「人类与神奇宝贝的关系」。虽然首藤刚志最初构思的幻之结局与幻之电影最后未能保留，而且早期的一些设定被废弃（爱好者所说的去地球化），但是首藤刚志依旧为《神奇宝贝》系列世界观奠定基础，不管后面的编剧如何调整，无印篇的设定大致得到保存和延续。
动画《神奇宝贝无印篇》于1997年4月1日首次播出，一直到2022年11月14日播出最终集宣布完结，若包含已经删除的《电脑战士3D龙》无印篇总共有276集，是名副其实的长篇动画。而相较之下《数码宝贝大冒险》的播出时间是1999年3月7日-2000年3月26日这短短一年时间，总集数仅仅为54集就匆忙结束冒险。
《神奇宝贝无印篇》的制作团队有数年时间调整世界观构思，通过动画和电影搭建新世界，而且首藤刚志在淡出之前还担任前三部电影的编剧，这使得系列作品是连贯的。而《数码宝贝大冒险》的54集剧情根本不足以支撑庞大数码世界的基础设定，尤其是黑暗四天王篇质量明显下降，太一他们打完启示录兽回家的时候小智连徽章都未能集齐。
虽然理论上《数码宝贝》能再推出新作填充数码世界的设定，可实际上仅仅第一部《大冒险》与第二部《大冒险02》的世界观是连续的作品，从第三部开始直接推倒重来，甚至有时候新任编剧自己都不知道《数码宝贝》系列具体情况、是怎样的作品。
所以，连世界观都无法搭建起来的《数码宝贝》很自然而然就完全衰落，连基于第一部重启作品都相当糟糕。至于《神奇宝贝》固然毛病有一堆，但是最成功的地方是保障重要事件：小智与皮卡丘在基本不变的世界观（去地球化之后贴合游戏，不再折腾）向着成为神奇宝贝大师的道路前进。
