在当时的历史背景下，李斯确实是一位贤士，但是由于小人得道，皇帝也是昏庸无能，亲小人远贤臣，最终下场挺惨的。只能说李斯投错了胎或者生错了年代，否则也不会落得如此下场。
秦郎中令赵高依仗二世恩宠专横跋扈，为报私人恩怨大开*戒。他害怕大臣上奏，就把他做的坏事说给了二世听，于是向二世进言：“天子之所以尊贵，不过是因为群臣只能听到他的声音，却不得以一睹他的天颜。况且陛下是很年轻的，可能对某些事情并不十分了解，现在坐在朝廷上听群臣禀告此事，赏罚举止如果有什么不对的地方，就把自己的不足暴漏在臣子眼前，从此便不能向天下人显示您的圣明了。所以陛下不如深居宫中，由我和熟悉法律的侍中们一起等事情入奏，奏报收集上来以后，我们再辅助您逐一批复。这样，就没人敢拿是非不明的事情胡乱奏报了，天下人也会因此称您为圣明的君主。”
二世听从赵高的话，不再上朝接见大臣们，常常住在寝宫里。赵高随时侍奉在二世左右，掌管事务，独揽内外大权。
一起参与“沙丘之谋”的丞相李斯随这件事甚为不满，赵高听说以后，就去见李斯说：“现在关东地区盗贼很多，皇上却增加徭役去建造阿房宫，搜集猎狗快马这些无用的东西。我想进谏，唯恐内外身份有别，有所顾虑。这其实是您分内的事情，您怎么不规劝陛下呢？”
李斯说：“是啊，我很久以前就像进谏了，但是皇上现在幽居深宫，不再上朝。我想对他说的话也只能当面陈述；想求见他，但是他没有时间。”
赵高说：“您如果真的能劝谏皇上，等他空闲的时候，我一定及时请您过来。”
遇事赵高就专门等二世正在饮酒作乐、没人翩翩起舞的时候，派人通知李斯：“皇上现在闲着呢，您赶快去上奏。”李斯就到宫门口求见。
屡次发生这样的事情，二世生气了说：“我平常有空，他不来；我正在寻欢作乐，他就来报告国事。难道李斯认为我年少无知，还是认为我见识浅陋？”
赵高趁机进谗言说：“丞相当初参与了沙丘密谋。现在陛下已继位做了黄帝，而丞相的地位并没有提高，他今日之举是有意迫使陛下同意他裂土为王。而且陛下您不问我，我也是不敢说的，三川郡守李由乃是丞相之子，楚地反贼陈胜等人都是丞相家乡临近县邑的子弟，因此他们才敢公然横行，经过三川城下，李由竟然放任反贼通过。我还听说他们又书信来往，因为还没有核实，所以不敢禀报陛下。而且在宫外，丞相的权利比您还要打呢。”
二世被赵高的谗言给蛊惑了，想惩办李斯，但是有害怕情况不实，就先派人调查三川郡守李由跟反贼交通情况。
李斯听说这些事情后，就上书揭发，但是二世不信。二世想来很宠信赵高，怕李斯*了赵高，就告诉他李斯进谏的话，赵高说：“我赵高 是丞相唯一忌惮的人、我死后丞相恐怕就要学田常造反了。”
这个时候，全国各地的起义已经风起云涌，朝廷不停地征招关中士兵往东攻打义军。左丞相冯去疾，右丞相李斯，将军冯劫为此劝谏二世，劝他暂缓修建阿房宫并减轻徭役。
二世非常生气，便让人把这三个人压入大牢，并交给掌管刑狱的官吏，立案审讯他们还有没有其他的罪过。冯去疾冯劫自*，只有李斯进了监狱。二世让赵高亲自审理李斯一案，查问李斯与儿子李由一起谋反的情况，逮捕了李斯宗族、门下所有族人、宾客。赵高残害李斯，对他们进行严刑拷打，李斯忍受不了苦楚，终于被屈打成招。
电视剧《神话》-赵高
李斯之所以没有自*，是因为觉得自己还是有用的人，而且对国家也是有功劳的，况且谋反的罪名子虚乌有，想上书为自己辩解，盼望有一天二世能能明白自己的委屈，然后赦免他的罪名。
李斯抱着希望从监狱上书，但是被赵高知道了，赵高为了不让二世看到李斯的上书，就命人把书信给扔掉，然后又派人假冒御史轮番审讯。只要李斯靠口说实话翻供，就再严刑拷打，后来二世派人验证李斯的口供，李斯以为还会跟以前的日子一样，最终违心任了罪，最终被处以五刑之一，在咸阳街市腰斩。而李由已经在和起义军交战中被*了。
最终，李斯三族之内都被株连，二世任命赵高做了中丞相，事情不论大小都由他决定。
