他独自开着小潜艇携带着鱼雷核弹，潜游在海底三万里下的古埃及遗迹。出了舱门后，他摘掉头盔，独自拾级而上，逐渐靠近辐射强烈的地核和奄奄一息的哥斯拉。手动调了下鱼雷核弹爆炸的时间，走到哥斯拉的面前，用手摸了一下他，用日语说了一句“再见了，吾友。”
奄奄一息的哥斯拉，竟然睁开了眼睛看他一眼，随后就是爆炸了。芹泽博士随着爆炸飞灰湮灭，哥斯拉却复活了。
这一段路可以说是芹泽博士一个人的朝圣。感人。
在潜水艇里，男主看到芹泽博士的怀表就想起来儿子安德鲁曾经跟芹泽博士的对话。
男主的儿子安德鲁是因为哥斯拉而死的，男主恨死了哥斯拉。在安德鲁小的时候不理解博士为什么把一块坏掉的旧怀表带在身上，经常故意地问芹泽博士：“几点啦？”博士每次都是笑一笑地给出同样的答案:“是时候换一个新手表了。”
随后芹泽博士又跟马克说了这样的一句话：“有时治疗创伤最好的方法是与造成创伤的东西和解。”
这句话既是对马克说的，也是对他自己说的。
哥斯拉是生态平衡的拯救者，马克因为失去儿子而痛恨哥斯拉，芹泽因制造出氧气破坏者*死哥斯拉而愧疚。想要治疗创伤，最好的办法是与创伤和解。
所谓的氧气破坏者，是利用特殊物质产生电磁反应，将水中的氧气一瞬间破坏，*死一定范围内的生物。
哥斯拉之所以帮助人类是因为它的使命是维护平衡生态。
电影里人类戏份的减少，是为了说明人类的弱小。即使武器、科技再先进。
