此后他的年纪虽然已经不再年轻，但依旧活跃在演艺圈中，参演了《零公里》等作品，最后一部作品是在2009年的《良心无悔》。
2011年，曹秋根因胰腺癌住院，10月1日的时候，他在网上发文感谢大家的关心，并承诺自己会斗争到底。然而不幸的是，在18日凌晨，他还是在上海离开了人世。
因为曹秋根生前就很低调，再加上当时网络还不普及，因此许多人都并不知道他已经离开的消息。
曹秋根有一个女儿阳阳，父亲去世的时候，她曾用曹秋根的社交账号发文公布这一消息，透露爸爸已经和病魔斗争了2年，创造了不少奇迹，她非常为爸爸自豪。
希望这位老戏骨在另一个世界一切安好。
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