当时杨过发现耶律齐与蒙古人在一起密谋，于是出手阻止了耶律齐打开襄阳城门，耶律齐不是杨过的对手，最终被杨过打成重伤，撂倒在地，郭芙赶了过来，知道了一切，原来外公、段智兴和老顽童之死都是耶律齐一手造成的，郭芙质问耶律齐为什么这样做？耶律齐说郭芙不生孩子，郭芙告诉耶律齐其实是他的原因，只不过黄蓉、郭靖不想伤害耶律齐自尊，所以没让郭芙告诉耶律齐，没想到耶律齐不知好歹，郭芙为了给外公报仇，于是捡起地上的剑，一剑刺死了耶律齐，然后要自*，到九泉之下，给黄药师、周伯通、段智兴赔罪。结果被小龙女拦下，杨过看到郭靖的首级悬挂在襄阳门前，深感欺人太甚，于是要夺回郭靖首级，结果被三大高手围攻。
杨过虽然实力惊人，但是早年断了右臂，加上长期生活在古墓这种潮湿的环境之中，最终患上了严重的类风湿性关节炎，实力大打折扣，最终被三大高手撂倒在地，郭芙和小龙女拼死相救，形势危急，小龙女让郭芙带着杨过先回城自己垫后，最终小龙女被*，杨过被郭芙带回了城。杨过当时十分苦闷，于是整天喝得酩酊大醉，郭芙十分理解，细心在杨过身边照顾，一边郭芙扶着杨贵回房休息，结果被杨过一把拉住，杨过让郭芙不要离开自己，然后紧紧抱着郭芙，并且亲吻郭芙，郭芙努力挣脱，但是无济于事，最终在杨过紧紧相拥之下，两个人缠绵悱恻到了一起。
第二天杨过醒来，十分自责，郭芙告诉杨过自己昨天也鬼迷心窍了，穿上了衣服，想要离开，杨过拉住了郭芙说道：“芙妹，我...我喜欢你，一直都喜欢，你能嫁给我吗？”郭芙没有说话，此时黄蓉派人来了，让郭芙、杨过过去，杨过和郭芙看到蒙古人兵临城下，大军压境，黄蓉让杨过带着郭芙赶紧离开，杨过不走，要跟黄蓉共进退，黄蓉说自己失去了郭靖，心如死灰，不愿苟活于世，想要血战到底，但是杨过和小龙女还有孩子，就算不为自己考虑，也要为孩子考虑。黄蓉说道：“你带着芙儿，赶紧走，难道你非要让我以死相逼不可吗？”杨过答应了黄蓉带着郭芙离开，临走前，黄蓉请求杨过好好照顾郭芙，杨过让黄蓉放心，一定会爱郭芙胜过爱自己。
就这样杨过带着郭芙回到了古墓，此时杨过和小龙女的女儿正在哭，郭芙抱起了孩子，哄着孩子，孩子就没有再哭了，杨过十分欣慰，后来杨过跟郭芙表白，郭芙答应了，就这样郭芙二婚，嫁给了杨过。后来郭芙为杨过生下一个儿子，名叫杨破天。郭芙对这个儿子寄予了厚望，从小就好好培养这个儿子，从小就将郭靖生前留下的降龙十八掌和《九阴真经》交给杨破天修炼，很快杨破天就将这两大神功融会贯通，实力相当了得。后来杨过将儿子杨破天带到了剑冢山，指点儿子杨破天修炼独孤求败的武功，杨破天先后经历了利剑、紫薇软剑、玄铁重剑以及木剑剑法，最后将剑法与内功融会贯通，达到了无剑境界，成为了天下第一高手。
