老鼠以草种粮食等为食物，而由于这场天灾导致百姓连年歉收，人都没有粮食可吃，更何况老鼠。上文史料也说明了，在山西地区，“民相食”“*父母炙而食之”。饥荒使人饥不择食，更何况老鼠。
老鼠身体内携带大量病菌，大量老鼠没有食物可吃，病毒在体内爆发，老鼠也越发的羸弱。同时人也没有粮食可以食用，尚可以人为食，以老鼠为食也就不足为奇了。结果可想而知，自然是老鼠体内的病菌就传入了人的体内。
明末大鼠疫起于崇祯六年，发源地是山西，这些史料完全符合搜史君的推测：
明末的气候变化，造成明朝全国范围内连年大旱，而山西最为严重，连年的饥荒造成了“鼠疫”的爆发，进而引发了“瘟疫”。
所以最终确定，“明末大瘟疫”的起因，并非“人祸”而是“天灾”。
众所周知瘟疫蔓延速度是极快的，《大明劫》中为了阻止瘟疫蔓延，医师吴又可向军营进言需要把军营中染病的士兵和正常的士兵分开，以防人人传染，开窗通风，防止疫气聚集。原因就是瘟疫可以通过口鼻呼吸相互传染。
当然，当时并没有说在孙传庭军中蔓延的就是瘟疫，吴又可称之为“疠疾”。
明末大瘟疫造成的影响比十分严重，从《大明劫》中我们也能够看出来，这“疠疾”可以进行人传人。而且由于医疗条件有限，死亡率也是极高，造成的后果也十分严重。
沿街小户，收掩十之五六，街坊间的儿为之绝影。有棺无棺，九门计数，二十余万也。---《明季北略》
而鼠疫最终演变成在人与人之间传染的瘟疫，与李自成也有很大的关系。随着流寇和明朝镇压的军队。鼠疫在明崇祯年间传入河北，随着李自成与明朝镇压的军队传到更多地方。崇祯十四年（1641年），鼠疫传到了北京，也就在北京形成了“京师大瘟疫”。
民间瘟神
所以搜史君以为，鼠疫之所以能扩大，有一下几种原因：
（1）流民四起，因为饥荒人们四处逃散，所致扩散。
（2）战乱频繁，起义军与镇压军队频繁移动，所致扩散。
（3）医疗意识淡薄，当时的人并不知道“瘟疫”“疠疾”可以通过飞尘散播，没有防范意识，所致扩散。
（4）天灾大旱，老鼠为了寻找食物，频繁迁徙所致。
