2007年的三十万元，轻易让王海军家属泯灭良心，不去惩治凶徒慰藉死者。待江阳和朱伟驱车赶来，正巧与银色面包车失之交臂，车上坐着一众亲人，携着骨灰盒扬长而去，原以为真相终将大白，到头来仍在他人圈套里，霾晦蔽日，不见天光。
陈明章接到电话，连夜返回平康，三人重聚一桌，再无欢声笑语，除了叹不尽的惋惜以外，还有朱伟宣布退出调查。江阳始料未及，从没想过平康白雪会有妥协的时候，直到朱伟分析卡恩集团势力，陈明章提及郭红霞母子，显而易见的潜在威胁让江阳低下头，手中攥着婚戒，仿佛身体里的生气都被抽空，过去许久，艰难又坚定地做出离婚抉择。
由于江阳坚持申诉，所以胡一浪主动邀请他到高档会所包厢，先后用美色和金钱诱惑。纵然江阳全都拒绝，却被隐藏相机拍下全程画面，随着断章取义的照片，会所小姐的口供，再加上江阳家里莫名搜出的三十万现金，县纪委受理调查，坐实江阳行贿索贿，一审判处五年刑期。
张超成为江阳二审刑辩律师，也曾咨询过导师申教授，因此认为只要承认受贿三十万，便能从轻处罚，再加上先前待在监狱里可以折抵刑期，所以最终判决两年。待到判决书下达，江阳出狱，身败名裂，只有陈明章和朱伟等在门外迎接。
两年时间不长，足以毁掉一名检察官的意气风发，如今他沦为极不起眼的中年人，沧桑且自卑，佝偻着瘦弱的身体，就连笑容也都略显拘谨。陈明章得知江阳在监狱里学习手机维修，于是帮他盘下店铺，赖以为生。
2009年，吴检即将面临退休，他在一家破旧门脸房前驻足良久，似乎下定决心，终于领着公文包进去。此时江阳正低头专心修理手机，看到来人后仔细辨认，不由惊喜交加地请他进屋喝茶。
一番嘘寒问暖后，吴检言归正传问起侯贵平旧案，江阳闻言稍愣，聊到近些年屡遭破坏的线索，声音逐渐哽咽。吴检心怀愧疚，拿出一份牛皮纸档案袋，里面是侯贵平遗留的性侵名单和照片，承认当初没有足够勇气调查，导致许多人枉死。
看着年近六旬的老人坐在椅子上失声痛哭，江阳从最初的质问到后来沉默，他再也不忍心责怪，却有一种无能为力的虚脱感，几近崩溃。
陈明章生意越做越大，时不时拉上朱伟和江阳小聚，眼下证据已在手里，只需找到关键人证，相信无需多久便能拨云见日。朱伟善于活跃气氛，忘却先前不快，三人稍有片刻轻松，陈明章想到江小树下半年该升小学，于是提前备好红包，即便江阳极力推脱，但在他与朱伟的强行提议后，只能红着眼眶收下。
自从江阳入狱，郭红霞独自抚养儿子养大，再未改嫁。陈明章和朱伟心知肚明，劝说江阳不要辜负好女人，以后找个时间复婚，好好过日子。然而江阳无法带给妻儿安稳生活，还要再添连累，一时间不知如何回应，正当他小心翼翼地将红包揣进兜里，忽然发现钱包被偷，连带身份证以及银行卡也都消失无踪。
钱包现金不多，却是点燃心结的导火索，江阳不停喃喃自语，触景伤情，想到这些年所经历的种种遭遇，随即缩在角落里嚎啕大哭，一阵剧烈咳嗦后，鲜血从嘴里喷出，令他当场晕倒。
江阳醒来是在医院病床，周围聚集很多熟悉的人，其中包括陈明章、朱伟、李静还有张超。经过医生检查，最终确定江阳肺癌中晚期，若是送往国外接受治疗，或许会有几年活头，但是江阳不想把生命耗费在毫无意义的光阴里，他决定用手中的证据将恶势力绳之于法。朱伟无法说服江阳，便把怒气矛头指向张超，他对往事耿耿于怀，如果不是张超贪生怕死，怎会让江阳白坐两年牢。
李建国担心照片曝光，立马给孙传福打电话寻找解决办法。朱伟知道照片内容正是卡恩集团诱逼少女提供性贿赂的过程，所以他与江阳七年里受到的痛苦要让那些人加倍偿还。轮到邮寄信件当日，匿名信并没有出现在报社里，直到临近下午，第六封信竟贴在报社玻璃窗上。
严良反复关联先前调查的线索，无论是张晓倩的口述；张超的供词；以及法医质疑的动力源，这几个重要细节让他直奔张超家，终于在客厅承重墙下发现长孔，因此猜测绳子可以从长孔里穿过去，从而造成他*假象。
警方调取报社监控，发现朱伟趁送水时递交第六封匿名信。朱伟利用江潭晚报发布爆炸信息，而严良则根据汽车遥控器购买相同型号玩具，紧接带着玩具去找江小树，怎料江小树竟然从未玩过遥控汽车。那么，遥控器真正的作用到底是什么？
《沉默的真相》第11集剧情介绍当年性侵名单里共有三位女学生，她们分别是翁美香、葛丽，还有目击者李雪。张晓倩赶往精神病院发现葛丽被人带走，于是立马拨通神秘电话说明此事，而接电话之人正是朱伟，他安排晚上十一点见面，随即通知李静准备实施开展第四套方案。
严良主动找到陈明章，向他咨询能否制造电子遥控，陈明章听出他话中试探，索性揣着明白装糊涂，与之周旋。眼下没能问到任何有用线索，严良只好先行告辞，俩人握手约定下次喝茶，陈明章目送严良离开。
由于《江潭晚报》迟迟没有发刊，警方在下午六点陆续收到读者投诉，通过详细调查，发现主要原因在于负责运输报纸的车辆遭到劫持。专案组通过监控录像寻找失踪车辆，怎料刘明洋突然发疯，待严良赶到精神病院时，好不容易稳定对方情绪，结果任玥婷打来电话，告知邮政车已经找到，嫌疑人供出是受卡恩集团指使。
当天晚上八点，匿名照片被上传到《江潭晚报》论坛，并且散布爆炸谣言。网警出动协助排查，针对账户进行定位，发现手机是在东城区都市家园附近发布信息。都市家园属于卡恩集团名下产业，然而顾一鸣前脚刚走，账户主人又跟帖留言数字“9”，倘若按照第一封匿名信的约定，那么今晚十二点钟将在城市某处地点爆炸，每隔三十分钟就会倒计时一次。
卡恩集团附近总有流浪汉徘徊，手里经常握着遥控，胡一浪从手下口中得知此事，脸色瞬变。严良站在有可能发生爆炸的地图前冥思苦想，最后敲定卡恩造纸厂。此时造纸厂传出氯气泄露的消息，工人们闻讯惊慌失措，纷纷向南大门逃窜，保安迫不得已拉响警报，随着数十辆警车相继抵达，朱伟混入人群顺利离开。
警方连夜召集省电力研究院专家，集体前往现场勘查，尚未发现任何违禁物品，通过调取锅炉运行数据和水表推断，应是有人关闭进水阀门，故而导致炉管过热，幸好及时干预避免爆炸发生。
严良猜测朱伟曾在造纸厂做工，于是吩咐小马调取近两年录用工人名单比对送水工名单，最终便将目标锁定在东湖水站，敲响铁门，第一次见到化名为周新民的朱伟，传说中的平康白雪。
对于严良突然到访，朱伟表现得极其平静，仿佛早已预料般，十分淡然地回答着严良的每个问题。他耗费四个月时间摸清整个卡恩集团，包括造纸厂发生过两次严重氯气泄露，所以才能轻易疏散工人，通过陈明章与张晓倩的配合，短短时间内跑遍整个江谭市，分散警方注意。听着朱伟的阐述，严良感同身受，从心底里发出敬佩，于是希望他能够信任自己，承诺会让罪恶伏法。
坐在市局厅里，面前是数十名省高检领导，朱伟强压内心激动，带着江阳的生前期盼，向众人揭露真相，随着九宫格照片完整公布，黑恶势力逐一呈现，其中包括刑警大队长李建国；卡恩集团董事长孙传福与胡一浪，还有藏在幕后的原清州市副市长秦大川，以及他的女婿曾祥东。当年丁春妹身边的男孩正是葛丽儿子，也是她被曾祥东性侵后的亲生骨肉。因孩子刚出生便离开母亲，直到一岁时检查出患有急性淋巴细胞白血病，需要骨髓移植，而葛丽配型正好与孩子骨髓一致，所以她才有幸活下来，并被关在精神病院里。
如今翁美香喝药自*，葛丽下落不明，唯独李雪尚在人世。省领导听闻此事颇感震惊，同时感慨若非朱伟和江阳的奋不顾身，奔走呼号，恐怕侯贵平直到现在都要蒙受不白之冤。严良根据朱伟透露地址，立刻带人前往苗高乡去找李雪，警车停在苗高乡中学门前，张晓倩默默坐在教室里，等候多时。
《沉默的真相》第12集剧情介绍孙传福等人得知张晓倩经由严良护送，此时已在回程途中，于是不惜一切想要进行阻止，提前派人等在半路伏击。警方与其展开激烈枪战，最终抓捕全部犯人，胡一浪也被当场击毙。
赵伟民再次联系省厅领导召开专项大会，张晓倩首次以李雪身份出现在众人面前，她坦言当年目击侯贵平拒绝丁春妹并将她强行推出门，怎料黄毛伙同其余几人用被子将他捂死。侯贵平死后，张晓倩辍学进入工厂，即便如此仍是没能逃离魔掌，留下一段最为不堪的黑暗过往，每天做着相同噩梦，只有一台老式收音机为伴。
正是因为这台收音机，让她真正了解正义与法制，也通过拨打相关法制栏目向韩克朋局长求助，并在他的建议下，保留好案发时的证据，写一封详尽的案件陈诉，将两样东西装在一个信封里，再以邮寄方式作保存，待时机成熟选择报警。
后来张晓倩听闻朱伟队长平反过不少冤假旧案，于是半夜给他打电话透露侯贵平死因，可惜话还没说完，就被自家舅舅找过来，打断交流。当初的李雪改名换姓，变成如今的知名大记者张晓倩，七年的时间让她几乎忘却，直到遇见江阳，如同一缕阳光照进内心阴暗角落，掀开自欺欺人的伪装，暴露出无数道血淋淋的伤疤与事实，原来有些人必须行走在阳光下，才能不留遗憾。
江阳理解张晓倩的苦衷，也明白作为女孩出庭作证所要面临的后果，他独自回到家里，洗去满身的疲惫，继续考虑如何翻案。儿子江小树端来感冒药，没有拆穿江阳的善意谎言，只是哽咽着问起人若消失会去哪里，江阳强压酸楚，认真地回答这个问题，他说人死后会到天上，如果小树思念爸爸就找一朵天上的云，仿佛这就是父子俩的约定。
当天夜里，江阳辗转难眠，思及郭红霞嫁给自己未曾有过安稳日子，不禁有些愧疚。然而郭红霞毫无任何怨言，她在这些年里默默支持丈夫，最好的确不是最合适的，但这个最合适的女人已成为江阳心里最好的妻子。
2009年8月6日，江阳癌症已到晚期，仅剩五个月的时间，他在临终前联系所有人，其中包括朱伟、张超、李静，以及法医陈明章。五个人聚集在房间里，江阳宣布要以死维护程序正义，想用自*引起社会广泛关注，并且叮嘱他们将事件发布到网上，或许还有翻盘机率。没有人同意江阳的决定，但是张超却理解他的想法，愿意提供帮助，也愿意说服大家一同帮助。
2009年9月9日，几个人重聚一堂，相聚的气氛不比以往，却显得格外沉重。张超详细部署计划，以九宫格游戏展开二十四天的调查范围，陈明章负责装置，通过老年扶手的隔离和收缩作用，从而造成自*假象。就在大家商讨结束后，怎料张晓倩突然到访，自愿加入其中，利用媒体扩大影响范围，倘若严良可以参与调查，势必能够破获此案。
9月10日，待江阳交代完后事，三个兄弟抱在一起痛哭，陈明章带着朱伟离开，留下江阳独自坐在客厅，等待张超回家，实施计划的第一步：“争执”。两个人因争执发生打斗，引来警察上门登记调解，等到警察走后，张超模拟勒死江阳，而江阳则挣扎着用指甲抓破张超脖间皮肤。
次日晚上，张超离开家，乘机飞往北京。江阳穿着张超衣服，开着张超的汽车回到小区，他把遮阳板翻下，头靠后躲在车内的黑暗中，所以小区监控没有拍到他的脸。进入房间后，江阳准备一番，将脖子伸进设备上的绳圈，紧接拿出遥控开关，闭上眼睛，握紧拳头，直至绳子逐渐缩紧。
韩克朋局长已成现任省委*，他也坐在会议大厅内，看着张晓倩拿出江阳生前留下的录像。大屏幕中，江阳平静地陈述着一段往事，让大家了解到他是如何接手这起案件，再到期间遭受的各种磨难。十年冤案平反路，简直触目惊心，几个人从未想过放弃，凭靠信念支撑起一座名为“真相”的大楼，沉默且痛苦地迎接着正义的光临。江阳自*的画面深深映入众人眼帘，在场观看的公职人员无不落泪，这个也曾意气风发的人民检察官，终于在七年后的今天挣脱黑暗，等到属于他的阳光。
江谭市公安局专案组在掌握充分证据之后，对涉案人员实施抓捕，抓捕过程中，除孙传福畏罪自*外，其余犯罪分子全部落网。2010年9月2日，江谭市中级人民法院对孙传福恶势力团伙共5人进行公开宣判。
七年后，江阳墓前，朱伟、张超、陈明章等人均已出狱，他们和郭红霞母子、李静、张晓倩、任玥婷以及严良前来祭奠。这些举着火把的人，照亮无数百姓的黑夜，江小树接过严良手里的弹力球，看着乌云逐渐散去，露出碧蓝的天空。陈明章与严良再次握手，他将玩具车遥控再次交给对方，如同严良当初交给他，既不点破，维护各自的正义。
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