在海上护航方面，海军包括“基德”级军舰及“成功”级军舰所组成的特遣队，为专机开辟“安全航道”，为防范来自水下的威胁，具有1600公里航程的空军P-3C反潜机也在屏东基地准备。
“基德”级军舰
P-3C反潜机
马英九登岛发表谈话 强调南海“主权”
马英九登上太平岛后，发表了长篇讲话。讲话极长，有近5000字，小编节选了一些，虽然一些观点和政治主张与大陆不尽相同，但在维护南海主权这一点上，说出了两岸中国人的共同心声。
马英九开宗明义强调：南海诸岛是“我国”先民最早在西汉时期（公元前一世纪）发现、命名与使用。最晚在清康熙年间（1721年以前）开始，已将南海诸岛正式纳入海防体系，进行巡视和管理；1912年民国成立后，“我国”政府也相继在1935年1947年出版南海诸岛的地图，向国际社会重申“我国”对于南海诸岛及周遭海域的主权。
虽然两岸对于“我国”的政治意涵有所分歧，但并不妨碍两岸以各自的方式共同维护中国的主权和领土完整。
针对菲律宾向海牙常设仲裁法庭提出南海仲裁案，主张太平岛只是一个岩礁（rock），不是岛屿（island），马英九以大量事实加以驳斥：
根据地质学研究，太平岛的形成历史可能超过3百万年，而在2万年前，太平岛还曾经高出海平面达一百公尺以上。这段地质史或许可以说明，为何太平岛成为南沙群岛中，唯一具有可饮用淡水的岛屿。
太平岛全岛蓄积丰富的地下水，不仅可以直接饮用，口感也像市售矿泉水一样良好。
