两宋时期,南方地区的人口大幅增长,更多的地方被人类开发成农地。大熊猫在人类的步步进逼下,失去了更多的栖息地。这一时期,除了四川盆地、两湖盆地和鄱阳湖盆地这些传统农业区,在湘中盆地、赣江流域和沿海地区,大熊猫也失去了自己的栖息之地。
到了元明和清代中前期,大熊猫的栖息地迅速沦陷在了人类的手里。其分布区完全收缩到了西南地区,主要分布在四川盆地周边的山地。只有四川、甘肃、陕西、湖北、湖南、广西、贵州、云南八省的地方志中,还能找到大熊猫存在的痕迹。
到了清代中晚期,大熊猫的栖息地进一步收缩到了四川盆地北部和西部的山地。早期在滇东北和鄂西北还能寻到痕迹,后期则已经完全收缩到了川陕甘三省之间的一片C形山区。