蝙蝠的起源是怎样的，听人说蝙蝠是老鼠进化而来的，这显然是子虚乌有的，老鼠与蝙蝠长得也不像，更没有任何关系，两者之间八竿子打不着。不过，老鼠与蝙蝠同属于哺乳动物，如果按这个辈分来算的话，它们在2.08亿年前拥有共同祖先，其实并不仅是它们两个，就连人类以及现如今世界上所有的哺乳动物在2.08亿年前都拥有共同的祖先，而地球上所有的生命在大约38亿年前也都拥有共同的祖先。
蝙蝠即翼手目动物，全世界共有960余种蝙蝠，分为大蝙蝠亚目、小蝙蝠亚目，大蝙蝠亚目下面只有狐蝠科一个科，主要是食果蝠，这一类食果蝠有眼睛，视觉良好，喜好吃花蜜、花粉、果实。
小蝙蝠亚目下面分类众多，960多种蝙蝠其实大多都归类为小蝙蝠亚目，都是小蝙蝠亚目下面的科、属、种。小蝙蝠亚目眼睛很小，主要靠回声来定位。这类蝙蝠又可以称之为食虫蝠，主要吃肉吃虫，也有的品种喜吸食血液，比如吸血蝙蝠。
关于蝙蝠的起源，目前说法不一，这是因为蝙蝠的骨骼脆弱，保存下来的化石数量极少，没法完整地拼凑出蝙蝠的进化史，所以也就无法确定蝙蝠的起源以及演化过程是怎样的了。
从已经发现的化石证据来看，目前发现的最久远的蝙蝠化石距今5000万年，这说明在5000万年以前已经有古蝠了，从显示的蝙蝠骨骼结构来看，古蝠可能先是学会了在树与树之间滑翔的本领，继而飞向了天空，这表明古蝠原本生活在树上，常在树林间觅食。
有一种说法认为大蝙蝠亚目与小蝙蝠亚目起源是不一样的，大蝙蝠亚目的起源到现在还弄不清楚，因为它的化石发现的很少，仅在渐新世至中新世的欧洲等地有零星发现。
小蝙蝠亚目的化石发现的较多一些，人们推测小蝙蝠亚目可能起源于远古时期的小型食虫目。
虽然目前发现的最早蝙蝠化石距今只有5000万年，但是从哺乳动物的遗传谱来看，蝙蝠的演化史恐怕有8000万年那么久，这样说的话，蝙蝠也是经历了6500万年前的那场生物大浩劫幸存下来的物种。
还有的说法认为，大蝙蝠亚目与小蝙蝠亚目起源是一样的，可能在8000万年前拥有共同的祖先，而祖先可能就是类似食虫目的最原始的真兽类。
