同属西斯拉夫的捷克和斯洛伐克这两个民族在历史上曾建立自己的大摩拉维亚王国：捷克在西，山岚环抱；斯洛伐克在东，北面临山，南部是平原。两个民族的分野起源于公元9世纪：来自亚洲草原的游牧民族马扎尔人入侵了大摩拉维亚王国。凭山据守的捷克人维持了自己的独立性，后来又归入神圣罗马帝国；而斯洛伐克则被马扎尔人征服，后来马扎尔人建立了匈牙利王国。
从此斯洛伐克成为了匈牙利王国的一部分：如今斯洛伐克的首都布拉迪斯拉发在匈牙利王国统治时期被称为普雷斯堡。历史上这里曾长期作为匈牙利王国的首都存在。捷克与斯洛伐克两个民族的历史至此形成分野：捷克受到日耳曼文化的影响，而斯洛伐克则更多是受到匈牙利文化的影响。从11世纪起捷克被纳入到奥地利的哈布斯堡王朝统治之下。1526年奥地利哈布斯堡家族的查理五世加冕为匈牙利国王。
这时处于匈牙利统治下的斯洛伐克也随之归属于奥地利君主管辖。捷克和斯洛伐克再次被置于同一个国家的管辖之下。当然这个国家并不是一个以捷克人或斯洛伐克人为主体的国家，而是一个由奥地利哈布斯堡王室统治的囊括匈牙利、捷克、斯洛伐克等多个族裔的多民族国家。哈布斯堡王朝在捷克实行相对较为开明的君主制度。捷克的工商经济由此开始繁荣起来。
进入到近代的工业化时代后捷克成为了中欧工业革命开展最早、工业化程度最高的地区；相比之下斯洛伐克则成为了农奴庄园国家，其教育、文化水平等所造成的思想观念与捷克差别很大。这实际上已埋下了两个民族日后出现分歧的种子。1867年哈布斯堡王朝统治下的奥地利帝国改组为奥匈帝国：奥地利皇帝和总理兼任奥匈帝国皇帝和总理，在军事、财政、外交三大权力的执行上由位于维也纳的帝国政府控制。
