笔筒树
笔筒树（Cyathea lepifera (Hook.) Copel.），是一种孑遗植物，意思是从古老年代遗留下来的植物，祖先来自侏罗纪的亿万年前，以孢子繁殖，生长在山坡凹陷处或较潮湿阴暗的原始森林中，被称为现金活化石。笔筒树的老叶脱落后会在茎干上留下呈三角形的椭圆形叶痕，整个树干看起来就像蛇皮上的鳞片斑纹，所以又称蛇木，茎干上半部去髓部干燥后，可作为古色古香的天然笔筒，这便是「笔筒树」树名的由来。
1975年的华盛顿濒绝野生动植物贸易公约，笔筒树列为二级保护植物，这种被世界各国视为珍宝的大型树蕨，全球仅分布于东南亚地区，北从日本琉球群岛，向南经过台湾、菲律宾中部帕纳岛，中国福建沿海山丘则留存少数天然植株。几年前，笔筒树短期之内大量枯萎，在夏季的发病状况似乎更形严重。前后花了三个月时间，记录一万六千多株罹病的笔筒树，罹病的植株除了中心叶片褐黄化或红化萎凋之外，髓心组织亦出现褐化腐败，并发出异味。
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台湾原始观音坐莲
台湾原始观音坐莲（Archangiopteris somai），在我国主要分布于台湾。莲座蕨科全世界约有两百多种，它们的起源可追溯至蕨类繁盛时代之前的古生代，随着地球环境的改变，绝大多数成员先后灭绝，而现今残存者仅有两个目共六个科。这样的起源于热带的植物在中国大陆南方地区及台湾地区均有分布，常被视为多次冰河期后进入避难所而种化之新物种，这样的植物代表的不只是台湾特有的物种，更记录了它们的演化历史。
在台湾南投县鱼池乡大雁村山区溪边发现台湾原始观音座莲，生长地点紧邻山谷溪流，经农委会特有生物研究环保中心踏勘，确认台湾原始观音座莲是起源于古生代石碳纪距今约三亿年前的植物，可说是蕨类的祖先，比恐龙更久远的活化石，台湾特有，但整个台湾地区数量不到一千株，属濒临灭绝植物。
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台湾金狗毛蕨
台湾金狗毛蕨（Cibotium taiwanianum Kuo）在我国主要分布于台湾，全世界有五属，台湾地区有一属两种。台湾原生金狗毛蕨有两种，均属于蚌壳蕨科，一种为金狗毛蕨，另外一种为台湾金狗毛蕨。金狗毛蕨分布于印度、东南亚和菲律宾，在台湾极为稀少，仅在台中县及南投县有发现。金狗毛蕨是早期农业社会居家必备的止血良药，一般民众都将其视为珍品，由于分布稀少，种植困难，但却有极高的药用价值，现已处于濒危物种，已被CITES国际红皮书中列为保护种类，禁止买卖，禁止输出入的植物。
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苏铁蕨
苏铁蕨（Brainea insignis (Hook.) J. Sm.），全世界只有一属一种，是一种比较大型的附生蕨类植物，通常被归类于地生植物，生于温暖、潮湿的热带雨林，常附生于大树或岩石上，耐高温，在高温多湿条件下，终年可以生长，冬季温度不低于五度，具耐阴性、耐旱性，倾向荫蔽且空气湿度较高的环境。现在苏铁蕨的数量相当稀少，急需加强保护培育，苏铁蕨和苏铁的外型极为相似，但从一些外型的特征还是可以区别，从所属类别来看，苏铁蕨是一种大型蕨类植物，而苏铁则是一种远古的裸子植物。苏铁蕨不仅观赏价值很高，也是非常珍贵的古老植物，它的存在对研究第三纪古生物有着重要的意义，已被列为国家二级重点保护野生植物。
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