1、治疗的首要目标是防止形成胱氨酸结石
预防胱氨酸结石形成是治疗的首要目标。胱氨酸结石常常因为摄入大量液体而溶解，而新的结石则无法溶解，尽管胱氨酸并非唯一一种分泌过多的氨基酸，但它却是所有天然氨基酸中最难溶解的。胱氨酸会从尿中沉淀或结晶，在肾，输尿管，膀胱或尿道的任何地方形成结石。经皮肾碎石(PNL)是从一位年轻女性的肾脏中提取的胱氨酸结石，体积约为硬币的四分之一。PNL是致密、顽固性膀胱尿结石的粉碎、清除方法。膀胱尿患者应该明白“对于他们来说，水是一种必需的药物。”
2、有严重症状的病人可能要去医院。
该疗法旨在缓解症状，预防进一步结石形成。症状严重的人可能要去医院。膀胱尿症的治疗重点是减轻症状，防止结石形成。首先要尝试一个比较保守的方法。其中包括增加液体的摄入量，定期监测尿 pH值，饮食限制(即少吃盐)，补充柠檬酸钾以提高尿 pH值。若这些方法不能阻止结石的形成，就可以加入有助于溶解胱氨酸晶体的药物。有些情况下，可能需要将液体通过静脉(由 IV组成)。尿的碱性增强可能有助于溶解胱氨酸晶体。使用柠檬酸钾或碳酸氢钠就能做到这一点。
食用少量的盐也可以减少胱氨酸释放和结石的形成。结石经过时，可能需要用止痛剂来控制肾或膀胱疼痛。小石块(5毫米或以下)通常是自己的小便流出来的。大块结石(大于5毫米)可能需要额外治疗。离体冲击波碎石术用声波穿过身体，集中到石头上，将其分解为可穿透的小碎片。与其它类型的结石相比， ESWL可能不能很好地治疗胱氨酸结石，因为它们非常坚硬。在经皮肾切开取石术中，将一根小管子从侧壁直接插入肾脏。接着望远镜穿过管子，直接把石头打碎。激光器可以用来打破结石，也可以用来治疗较小的结石。
3、尿量增加
多喝水、多喝水对增加尿量有好处。节食性钠对尿胱氨酸的排泄有很好的作用。尿液碱化可增加胱氨酸的溶解性，必要时使用硫醇螯合剂，尤其是D-青霉胺或巯基丙基甘氨酸。因为这些螯合剂具有明显的副作用，所以对于那些对保守治疗无效的患者，应该保留它们。患有感染性结石、有症状或阻塞的病人需要手术治疗。胱氨酸尿液为常染色体隐性遗传。这就是说，每个细胞中必须有两个负责基因突变的基因拷贝。父母通常都会携带一种突变基因，也就是所谓的携带者。通常情况下，突变基因没有表现出状态。
结语：膀胱尿是由于尿中大量的胱氨酸所致。通常大多数胱氨酸在进入肾脏后会溶解并返回到血液中。膀胱尿患者有一种遗传缺陷，可以干扰这个过程。因此，尿胱氨酸积聚形成晶体或结石。这类结石和晶体可以卡住肾，输尿管，膀胱。
