黄连素除了可以降低结肠腺瘤的复发率，还可以抗炎、抗菌、降压、降血糖、保护心肌等功效。
首先，黄连素的应用具有明显的抗炎作用，抗炎作用主要通过抑制炎症因子的生成和活性实现。既可以抑制白细胞的趋化运动，造成中性粒细胞呼吸爆发受到限制，影响羟自由基的形成、过氧化氢的释放、中性粒细胞磷脂酶活性等，进而炎症组织中前列腺素E2的含量，减缓或者中止炎症反应。
又能够抑制巨噬细胞释放一氧化氮、肿瘤坏死因子-α和白细胞介素-1β等，减轻炎症反应；另外黄连素还可以使肿瘤坏死因子、白细胞介素-6 等炎症因子的活性下降。
黄连素也是抗击细菌的“一把好手”，对革兰阳性菌和革兰阴性菌均具有作用，不过对革兰阳性菌效果更好。
黄连素作为广谱抗菌素的一种，对耐药性大肠埃希菌以及多重耐药的幽门螺杆菌也有抑制作用，且能干扰钩端螺旋体、肠伤寒、痢疾杆菌等生长繁殖。
黄连素能抑菌的机制尚不清楚，不过可能和抑制细菌生长、干扰细菌酶蛋白的活性、影响细菌的黏附等方面相关。
服用黄连素对于高血压、高血糖的人群来说，亦是益处多一些。黄连素能够通过上调一氧化氮合酶mRNA的表达，使机体内生成的一氧化氮增多，该物质增多能够起到舒张血管的作用，在一定程度上降低血压水平。
胰岛B细胞的功能障碍是导致糖尿病的重要原因，而黄连素能在一定程度上修复胰岛B细胞。研究表明，黄连素能够起到明显的降糖作用，主要和其增加机体对胰岛素的敏感性以及促进胰岛素分泌来实现降低血糖的目的。（参考来源：《黄连素的药理作用及机制研究进展》）
此外，黄连素还具有一定的抗氧化作用，能够通过抗氧化、清除自由基来保护脑组织。
一方面黄连素能够抑制烟酰胺腺嘌呤二核苷磷酸( NADPH) 氧化酶亚基的表达，减少超氧阴离子及下游产物等活性氧的生成。另一方面，随着黄连素浓度的升高，对脂质过氧化、遗传物质（DNA）断裂、蛋白质氧化降解的保护作用逐渐增强。
