红海两侧都是沙漠，几乎没有像样的河流，只有阿拉伯半岛南部的希贾兹山脉，有一些不知名的季节性河流，淡水注入量微乎其微。
红海西侧是撒哈拉沙漠，东侧是阿拉伯沙漠，为地球上面积最大的的两个沙漠，红海上空时有沙尘暴，年降雨量约 60 毫米。
红海是低纬度地区，纬度在北纬12°39'到29°57'之间，两侧沙漠地带夏季能达到50°C，年蒸发量约2050 毫米。红海地区就像烤串，东西两侧是炙热的火炉，烘烤中间的红海。
红海盐度在36‰-42‰之间（北高南低），平均为40‰，比大洋的平均盐度提升十倍，是地球上盐度最高的海域。
