淀粉具有遇碘变蓝的特性，这是由淀粉本身的结构特点决定的。
淀粉是白色无定形的粉末，它是由由10%～30%的直链淀粉和70%～90%的支链淀粉组成。
淀粉遇到碘的呈色反应，目前有两种分析：
一种是：直链淀粉是由α-葡萄糖分子缩合而成螺旋状的长长的螺旋体，每个葡萄糖单元都仍有羟基暴露在螺旋外。碘分子跟这些羟基作用，使碘分子嵌入淀粉螺旋体的轴心部位。碘跟淀粉的这种作用叫做络合作用，生成物叫做络合物。
在淀粉跟碘生成的络合物中，每个碘分子跟6个葡萄糖单元配合，淀粉链以直径1.3nm绕成螺旋状，碘分子处在螺旋的轴心部位。淀粉跟碘生成的络合物的颜色，跟淀粉的聚合度或相对分子质量有关。
在一定的聚合度或相对分子质量范围内，随聚合度或相对分子质量的增加，络合物的颜色的变化由无色、橙色、淡红、紫色到蓝色。例如，直链淀粉的聚合度是200～980或相对分子质量范围是32000～160000时，络合物的颜色是蓝色。
而分支很多的支链淀粉，在支链上的直链平均聚合度20～28，这样形成的络合物是紫色或紫红色的。糊精的聚合度更低，像棕红色、红色、淡红色等。
另外一种是：碘液中的碘分子嵌入到螺旋结构的空隙处，并且借助范德华力与直链淀粉络合在一起，这种络合物能够比较均匀地吸收除了蓝光以外的其它可见光(波长范围为400～750nm)，从而使淀粉溶液呈现出蓝色来。
支链淀粉同样具有螺旋卷曲的形状，但由于支链淀粉每个支链的平均长度较短，其螺旋大概有25--30个葡萄糖残基，因此分子中每段螺旋的圈数较少，螺旋中的短串碘分子比直链淀粉中的长串碘分子吸收波长更短的光，因此支链淀粉遇碘呈现较多紫色或紫红色。
所以一般情况下，淀粉和碘的显色就是直链淀粉遇碘呈蓝色，支链淀粉遇碘呈紫红色，糊精遇碘呈蓝紫、紫、橙等颜色。
淀粉溶液加热到100摄氏度时，无论直链淀粉还是支链淀粉，热运动都会使它的螺旋卷曲舒展开来，尽管淀粉与碘分子结合的配位键还在，但却不能形成成串的碘分子，此时，淀粉和碘分子作用的显色现象消失，当淀粉溶液冷却后，淀粉分子恢复螺旋卷曲的形状，再次形成成串的碘分子，因此淀粉和碘分子形成的显色现象又重新出现。
这就是淀粉遇碘变色加热不变色冷却又显色的原理！
