第三世代宝石系列虽然最后路比的第六只宝可梦“雪拉比”带众人进入平行世界的结尾没有收录，但是后来复刻版的始源红蓝宝石却处于平行时空，也算是一个特殊的彩蛋吧。
宝石系列的精灵设计取得了相当大的成功。引入了135种新宝可梦，将宝可梦图鉴增加至编号386。御三家火稚鸡、木守宫和水跃鱼每一只都风格独特。在经历了《金银》世代失败的御三家后，第三世代重回经典，画风也偏向于初代风格。首次出现地区图鉴的概念，这让玩家在收集方面的体验成倍增长。
对于国内玩家来说，GBA时期的宝石系列算得上大部分玩家的启蒙作。此时任天堂在国内知名度逐渐升高，由于国内游戏环境等影响，GBA不再是门槛极高的掌机。再加上画面表现丰富，更加受到欢迎。因此GBA时代诞生的宝可梦作品，在国内的影响力甚至要比国外还高。
在GBA停产落幕，电脑技术逐渐成熟之后，GBA时期的口袋妖怪成为了众多玩家尝试改版的首选目标，也是宝可梦改版游戏中组多的一个时代。为其加入后世代才有的精灵、mega系统、原创剧情等等，不仅是改版者最大的乐趣，玩家也玩得津津乐道。像是《漆黑的魅影》、《究极绿宝石》这些数年来一直保持非常高的传唱度。
