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罗红霉素是大环内酯类抗生素，属于快速抑菌剂，主要通过抑制细菌蛋白质的合成发挥抑菌作用，而阿莫西林是青霉素类抗生素，属于快速*菌剂，主要通过抑制细菌蛋白质的合成发挥*菌作用，抑菌剂可使细菌处于静止状态，无法生长繁殖，而*菌剂可直接*灭细菌，因此，阿莫西林的抗菌作用更强。
罗红霉素和阿莫西林都是临床上常用的口服抗生素，抗菌谱有所重合，对化脓性链球菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌等革兰阳性菌有较强的抗菌活性，在临床上都可用于治疗咽炎、扁桃体炎、中耳炎、鼻窦炎等上呼吸道感染、急性支气管炎和社区获得性肺炎等下呼吸道感染以及皮肤软组织感染，不同的是，阿莫西林是治疗上述呼吸道感染的首选药物，对阿莫西林过敏或无法耐受的患者，可以使用罗红霉素作为替代。
在临床应用方面，罗红霉素对支原体、衣原体、军团菌等非典型性病原体有抗菌活性，而阿莫西林对非典型性病原体没有作用，因此罗红霉素可用于治疗非典型性病原体所引起的呼吸道感染和泌尿生殖系统感染。罗红霉素还具有抗炎和免疫调节作用，可用于治疗弥漫性泛细支气管炎。
阿莫西林则对幽门螺杆菌有较强的抗菌活性，耐药率低，可与甲硝唑、克拉霉素等其他抗菌药物联合，用于根除幽门螺杆菌。
