品种优良的种子，是实现菠菜高产优收的基础。在选择菠菜种子时，一方面到正规农资店购买高品质的种子，另一方面要选择纯净度高、芽势强、适应力好、抗病性强、叶片厚绿、生长速度快、丰产性好的品种，播种前要把病害、损伤、霉变、干瘪的种子剔除，以此来确保出菠菜播种后苗齐壮，并有较好的长势、产量和品质。此外，因为菠菜一年四季都可播种，所以在选择品种时应当购买和使用符合当季种植的品种，不可盲目选择：
1、春菠菜选种
因为春菠菜生长前期时气温低、出苗慢、叶基分化条件差，到生长后期时回温快、光照长、生长期短、容易过早抽薹。为了春菠菜的叶片数量，也为了避免过早抽薹而减产，所以在春种菠菜的品种选择上，应当尽量选择叶片多、叶片肥大、抽薹期较晚的品种，如春秋大叶、迟圆叶菠、沈阳圆叶、辽宁圆叶等。
2、夏菠菜选种
因为夏菠菜种植生长期时正处于气温高、光照强的季节，在叶基分化、花芽分化以及抽薹等各方面生长又快又旺盛，但同时受高温强光的影响，夏菠菜呼吸作用强、水分蒸发量大、体内积累养分少，容易出现叶片生长受抑、产量品质差的问题。所以，在种植夏菠菜时，应当优先选择抗热抗病性好、生长快、易高产且不易抽薹的品种，荷兰比久、日本北丰、绍兴菠菜、圆叶菠菜、大叶菠菜、华菠1号、春秋大叶等。
3、秋菠菜选种
因为立秋后温度逐步降低、光照逐渐减弱，但此时白天气仍然比较高，所以在品种的选择上应当选择耐热性好、生长速度快、不易抽薹的早熟品种，如犁头菠、华菠1号、广东圆叶、大叶菠菜、春秋大叶、全能菠菜等，早秋菠菜建议选择圆叶菠菜品种，晚秋菠菜建议选择尖叶菠菜品种。
4、冬菠菜选种
虽然菠菜就有就很强的耐寒性，但冬季和早春温度低，开春温度回升快，十分容易发生过早抽薹的现象，导致菠菜减产和品质变差。所以，如果是种植越冬菠菜时，应当优先选用耐寒性好、冬性强、产量大且抽薹期较晚的中晚熟品种，如尖叶菠菜、菠杂10号、菠杂9号、圆叶菠菜、迟圆叶菠、华菠1号、圆叶菠菜等。
三、菠菜种子的处理方法相对于其他作物来说，菠菜种子的外部有一层坚硬厚实的革质种皮，如果直接把种子播种到土壤中去，土壤中的水、肥、气等很难渗透内部，容易出现发芽慢、出土迟、出苗不齐、苗黄苗弱弱的现象，十分不利于的正常生长发育。
为了提高菠菜的出苗率和幼苗齐壮，同时为了减少病害、保证菠菜后期顺利生长，因此，在菠菜种植前需要对种子进行一定的处理，在处理方法上常用的是浸种催芽、低温催芽、药液浸种催芽等。
1、浸种催芽
把提前挑选晾晒好的种子，放在清水中连续浸泡12-24小时，或者用25-30地的温水连续浸泡5-6个小时，然后捞出摊放或者用干净湿纱布包裹后放在通风阴凉处进行每天喷水保温保湿催芽，催芽期间保持20-25度左右的温湿度环境。
2、低温催芽
把提前挑选晾晒好的种子，先放在冷柜或冰箱内保持4-5度的低温中存放24小时左右，然后把种子转移到20-25度左右的通风温湿环境中进行连续催芽。
