那么，为什么神只单单认定诺亚为“义人”？神既然要灭世，为什么又要保留生命的种子？
这是诺亚方舟的传说中比较矛盾的地方，但更值得惊叹的还在后面。
可以肯定的是，如果这场大洪水的起因是有超自然力量的参与，那么必然当时地球上的人们与超自然力量之间发生了严重的分歧，让超自然力量产生了严重不满，以至于高高在上的超自然力量要把当时的文明抹除。
但为何在大洪水的波涛之下，神还是给了诺亚一家一线生机？仅仅是因为诺亚是地球上最后一个好人吗？
3500年前的记载已不足以阐明当时的真相，所幸的是，这个世界上其他的文明也流传有大洪水的传说，那么让我们把视角转向更为古老的记忆。
苏美尔人的神话中，风之神与众神之王恩尼尔觉得人类太吵闹，于是放出洪水、干旱和瘟疫来消灭他们。但是，个性良善的水神恩基传授阿拉哈西斯灌溉、贮存谷物以及医药的知识，人类因此得以存活下来。其后，水神恩基又破坏了一次众神之王恩尼尔的大洪水灭绝计划，也是事先安排了一个人（乌塔那匹兹姆(Utnapishtim)）搭船避难。恩基向大怒的众神之王解释道：为了必须的平衡，不应该完全灭绝无辜的人类。
这是大洪水记载的最早版本。也就可以解释前面神既要灭世又要保留生命的种子这一看似矛盾的地方。那是因为这些超自然力量中间对于大洪水灭绝计划存在着分歧。诸神之中慈悲的声音让这个大洪水灭绝计划最终选择了一个折中的方案：让大洪水抹除当时的文明，选择了神认可的生命继续下一个新生的文明。
如果真相真是这样，也就能解释诺亚方舟传说中更值得惊叹的地方：那就是诺亚方舟计划浩大的工程。光凭诺亚一家，真的能够完成方舟计划吗？
根据《圣经》上的记载，诺亚方舟长130米，宽22米，高13米，分上、中、下三层，每层都有一间间隔开的小舱房。若这艘方舟真的曾经建成过，其大小及排水量约为著名的泰坦尼克号(排水量约5万3千公顿)的五分之三。方舟总的容积达40000立方米，底仓面积8900平方米。
如此庞大的工程量，再加上要收集地球上的各种生命标本，诺亚一家要多久才能完成？况且方舟还使用了一种特殊的材料：歌斐木（据称是柏木，但又貌似没有确认这种材料）。这其中有没有超自然力量的协助？或者又印证了那个史前的文明曾经存在高度发达的工业体系？
如今再透过古老的传说探望洪荒，史前大洪水汹涌的波涛中，那艘载着人类希望的方舟正随着惊涛骇浪浮沉。而苍穹之上，众神对这世间的真相了然于胸，只是他们的目光已看向下一个轮回。
