修建水库大坝对鱼类造成的影响也不容忽视，为了更好地繁衍后代，长江黄河中的一些鱼类需要周期性的定向往返于两个或多个地方，就是我们所说的洄游。
但是水库大坝的修建在一定程度上影响了这些鱼类的洄游，从而影响鱼类繁衍后代，造成鱼数量甚至种类的减少。黄河变清意味着生存环境的改变，这些鱼类的未来充满了未知的挑战。
由黄变绿？绿色就是干净吗？还有人认为，黄河水其实并没有变清，只是“变绿”了，这种“绿”其实并不意味着干净。事实真的是如此吗？
到目前为止，黄河的年均输沙量已经降到了3亿吨以下，随着黄河水质变清，水的透光性也大大增强，因此水中的含氧量增加，藻类植物有了更有的养分和氧气来繁衍，我们所见的壶口瀑布呈现绿色，就是因为这个原因。
黄河变清之后有的地方的水体出现了绿色，一方面是值得高兴的事情，因为这确确实实意味着黄河水真正不断变得清澈，水质也在不断变好，但是另一方面我们也要辩证地来看到这件事情，水体过绿需要引起注意。
昆明滇池就是一个很好的例子，以前被人们称作高原之珠，但是却因为重视程度和保护力度有所欠缺，导致藻类泛滥，成为了人人避之不及的“臭水湖”，好在现在随着生态保护的不断进行，滇池水质已经改善了很多。
凡事过犹不及，如果黄河水中的藻类越来越多而又不加以治理，很有可能造成水体的富营养化，给国家带来更重的治理负担。所以需要严格控制含有氮磷等微量元素的生活用水排入到黄河中。
老话说得好，“水至清则无鱼”，什么事情都有两面性，但是就利弊来说，黄河变清总体上是利大于弊的。
从国家和社会层面看来，治理黄河是有利于改善民生的必要措施，黄河水的清澈也说明了我们国家的政策行之有效；
从生态保护的方面来看，还需要采取一些措施来减少治理黄河对鱼类和其他动植物造成的影响，比如人工育苗，定时开放水库大坝等等，黄河的治理是持久战，需要我们大家的共同努力。
