女性患胆结石症的概率要比男性高四倍；女性患消化不良比男性高；男性相较女性更容易罹患高血压和糖尿病……
医学界已经发现不少疾病的发病率男女有别，且症状表现和对药物的反应及疗效也是迥然不同，性别差异性医疗自然顺势而生。
脑垂体是人体内分泌的总司令，它坐镇于大脑正中、双眼后方，根据下丘脑传递来的各种信号决定各种类型的“促激素”的产量高低，一旦得病，表现出来的症状，男女差异颇大。
60%的垂体瘤患者具有性功能障碍，男性往往表现为阳痿、阴毛稀少等第二性征退化，多数因为瘤体长大压迫视神经，视力减弱才就诊，此时很多病人其实已经有平均三四年的性功能下降史了。而对于女性来说，引起医生关注她们的垂体情况的突出症状，经常是长期不孕。垂体瘤可导致催乳素水平过高，同时伴有雌激素减少，引发系列的内分泌失调。因此，对于婚后长期不孕的女性，或者是由于不明原因停经三个月以上，同时伴有乳房泌乳、视力下降、头痛等症状时，医生往往建议进行相关检查以排除垂体瘤。
抑郁障碍，影响不一男女在抑郁症患病率上的分水岭出现在13岁。13岁之前，男孩比女孩更易得这种病，随着身体的发育趋于成熟，女性的发病率开始逐步提高，到了育龄阶段更是“登峰造极”。而女性到绝经期之后，男女的抑郁症发病率差别就不再那么明显。
引起女性抑郁障碍的因素，与女性所担任的社会角色及相应的文化影响密切相关。“我结婚了，于是每次找工作面试都被询问：有孩子了吗？当我回答说还没有的时候，我就知道，我很可能得不到这个工作。”这是不少女性的体会。事实上，即使有工作的女性，也会面临家庭和工作的双重责任和压力。此外，当情绪低落的时候，男性会选择爬山和打羽毛球之类的体育活动来释放自己的情绪，而女性则喜欢在家里反复思考问题的关键所在。不过，这些分析包括一些旁人及自我的口头安慰，并不是应付抑郁情绪的有效方法。
美国密西根大学的心理学家苏珊·享客塞玛认为，女人的生理机制使她们更容易患得患失，放大生活中的负面因素。无独有偶，国内一项研究表明，女性重度抑郁症患者脑脊液中5-羟色胺（大脑内部一重要神经递质）的含量明显高于男性，因此情绪对女性的影响更大。
通常在青春期中期，女性抑郁障碍发病率明显增加，这可能跟性激素水平密切相关。肾上腺皮质激素系统的分泌和调控，也与年纪和性别有关。而这个关键因素，很好地解释了为何绝经后的女性和男性之间发病率差异不大。
自身免疫，靶点有异多发性硬化病、类风湿性关节炎，男女比例是1：2～3，系统性红斑狼疮性别的差异更大，男女比例达到1：9。
男女之间免疫应答的程度是有差异性的，女性对于免疫应答表现得更为强烈，会产生更多的抗体，提高细胞的免疫应答能力。从动物实验来看，雌性鼠比雄性鼠可产生更多的抗体和活性T细胞，体外实验亦证实，在雌激素存在的情况下，各种细胞免疫因子的分泌可以显著增加，而在雄激素存在的条件下，则分泌量降低。
男女之间显著不同的体内环境是这类自身免疫性疾病存在性别差异的重要原因。女性在*的9个月期间，雌激素和孕酮的水平显著增加，产后伴随着雌激素和孕酮的水平下降，多发性硬化症、类风湿性关节炎患者的症状可得到缓解，而对红斑狼疮患者而言，这种激素环境反而促进了该病的免疫应答，使得抗体产量增加，有可能使疾病恶化。
可见性别差异无所不在。1998年，美国国家卫生研究所确定了自身免疫疾病中的六大研究方向，其中之一便是“性别与自身免疫病”，更在近期拓展到了“监视人类所有疾病性别异同的研究”。
服药治疗，考虑性别基于疾病发病率及症状上的种种差异，医学专家将目光转移到治疗领域上的男女差异，他们观察到了一些很有趣的现象。
女性的心脏对药物往往更为敏感。根据药代动力学的研究，在排卵期和黄体期，安替比林通过肝脏代谢的速度要快于男性，曾有一些女性因此而死亡。
这种药物代谢的性别差异一部分可能与激素有关，而其他起作用的因素可能还包括饮食、体重、抽烟、饮酒、年龄等。绝经期前的妇女对很多药物代谢速度都比男性要快，如治疗哮喘的药物茶碱、红霉素、苯妥英钠等。
就一些常规心血管治疗用药来说，也存在着性别的差异性，阿司匹林对男性来说被证实可以帮助预防心脏病，却不可以预防中风；而对于女性则可以预防中风，但不能降低心脏病的发生率。阿托伐他汀是用来降低胆固醇的药物，以减少心脏病和中风的危险，然而相关研究表明，它并不能有效保护女性的心血管。地高辛可增加心脏收缩，但是女性服用的效果往往弱于男性。而在降压药的选择上，血管紧张素转换酶抑制剂（ACEI）对男性有效，而女性则往往对血管紧张素受体拮抗剂（ARB）更为敏感。
