孙中山的实业计划第三计划主要是在珠江流域展开，主要设计华南地区和西南地区。第三计划的核心是在广州修建一座南方大港，将广州建设成为亚洲的商业中心。其计划主要包含五部分，分别是：一，改良广州为一世界港；二，改良广州水路系统；三，建设中国西南铁路系统；四，建设沿海商埠及渔业港；五，创立造船厂。
第一部分，孙中山选择在广州建设一座世界级别的港口。孙中山认为，由于香港被英国占据，因此让南方失去了一个建设世界级别港口的位置。他主张在广州建设一个港口和香港竞争。另外，内地经济的发展，也有利于香港的进一步发展。广州位于西江、北江、东江汇合之处，被孙中山认为是中国最富饶的地方，如这里的农业可以三熟，蚕丝每年有八次之收成，蔬菜瓜果的产量也十分丰富。在三大港的设想中，只有广州港是大城市和大港口合二为一的，因此他十分看好广州。
第二部是疏通珠江流域的河道。孙中山认为应该疏通珠江入海口的航运通道，修建堤坝，使其能够通航。广州港的腹地也十分广阔，有两广和云贵，如果在加上铁路系统和其他地区进行了连接，那么就必定称为一座世界级别的港口。孙中山主张新建一座广州城，跨越黄埔与佛山，东边为商业中心，西边为工业中心。对珠江的几大支流，西江、北江、东江进行全面的疏通，以确保航运能够通畅。
珠江航道地图
第三部分就是建设西南地区的铁路系统。西南地区的云贵川都是矿产资源丰富的地区，因此孙中山主张修建广州通往各地的铁路，以发展经济。西南铁路系统包含7条铁路，分别是：广州—湖南—重庆线；广州—湖南—贵州—重庆线；广州—桂林—泸州—成都线；广州—梧州—叙永—成都线；广州—大理—腾冲线；广州—思茅线：广州—钦州线。可以看出，孙中山的西南铁路系统重点连接的是广州和成渝。
孙中山的西南铁路系统计划
第四部分是建设沿海地区的港口。按照孙总的计划，除了建设三个一级大港职位，还有建设4个二等港口，9个三等港口和15个渔业港。4个二等港口是营口、海州（连云港）、福州、钦州。为了建设这些港口，扩大港口的辐射面积，孙中山主张开凿松辽运河、徐海运河（徐州—连云港），平陆运河等。9个三等港口分别是葫芦岛、黄河港、芝罘（烟台）、宁波、温州、厦门、汕头、电白（茂名）、海口。15个渔业港就是安东（丹东）、海洋岛（长山）、秦皇岛、龙口（烟台附近）、石岛湾、新洋港（盐城）、吕四港（启东）、长涂港（舟山）、石浦（宁波象山）、福宁、湄州港、汕尾、西江口、海安（徐闻）、榆林港（三亚）。
第五部分内容是创立造船厂。中国经济发展必然需要大量的船只。当时世界海船总吨量为4500万吨，而孙中山认为中国至少需要1000万吨才能满足需求。而中国建设船只有许多有力的条件，如地价、劳动力十分便宜。中国要建造各种船只，包括商船和渔船。
