提到进化论，很多人会想到达尔文，因为达尔文的进化论是影响最广的一种进化理论。
有很多人反对进化论，这些反对者往往以达尔文的进化论作为靶子，通过否定达尔文的一些观点来否定进化论。
在相当长的一段时间里，达尔文的进化论是主流的进化论，被很多人视为真理。但是，随着现代生物学的发展，达尔文的进化学说越来越暴露出它的问题，现在的学术界已经不像过去那样推崇达尔文的进化论。
生物进化在学术界依然得到广泛认同，但具体生物是如何进化的，还存在不同的观点。实际上，对于生物进化的原因、机制、驱动因素、方向以及适应的起源等直到今天仍然没有完全弄清，但没有弄清楚并不表示生物进化被否定。
近年来，生物学研究方面取得了一些重要进展，特别是在基因及遗传的研究方面。新的生物学研究表明，基因的表达受到多层面的调控，大多数变化并不是基因本身，而是存在于基因调控环节的改变。表观遗传学是最近的热门课题，表观遗传的研究表明，生物性状的遗传会受到环境的影响，如环境中化学的、生物的因素，心理因素，这种遗传现象在很多的生物性状中得到证实。
有种种研究迹象表明，基因变异并非像过去人们所认为的是随机发生，自然选择也并非进化的主要推动力，生物的进化存在内因的“驱动”和“导向”。
现代生物进化的研究涉及到遗传学、分子生物学，研究遗传、变异以及进化因素（内因与外因）。现代生物进化的研究不像过去的那样只是在表观和抽象层次上，而是在微观分子层级上研究进化的机制。
关于进化论有没有被推翻的问题，主要争论发生在民间。一些反进化论的人只知道达尔文的进化论，而对现代生物学的发展一无所知，他们认为推翻了达尔文进化论就等同于推翻了进化论。当然，还有一些反进化论者另有企图，他们混淆视听，目的是为了兜售他们自己的东西。
