磁化杯是水磁化器的一种，将自然水放入磁化杯磁化后，便成为了磁化水。磁化水就是经过磁场处理的水，它的物理、化学等性质都会发生一系列的变化:如水分子氢链被破坏，长链水分子变为短链水分子和单个水分子，水的表面张力提高，溶解钙、镁盐类的能力增强，渗透压增高等，从而使磁化水具有溶石、消炎、止痛、抑菌、*菌，提高人体免疫功能的作用，所以磁化水对人体健康有很大的帮助。
用磁化杯磁化水是使水达到磁化目的的最简易的方法。但是，要使水达到磁化的目的，磁化杯的设计必须合理。磁的物理特性是同性相斥，异性相吸，如果在运动过程中两组磁力线相遇，磁力线就会互相排斥或者沿着相邻磁体转移，不能形成中心磁场。所以磁化杯的设计是很有讲究的。
水的磁化过程，就是分子在磁场中被磁力线切割的过程。水分子的运动在磁力的作用下发生改变，由此引起水的性质的变化，达到磁化的目的。然而并不是随便在杯中放一块磁体就是合格的磁化杯了。它的设计具体要求如下:磁体安放的最佳位置应是杯子的两侧，磁体之间的距离最好保持在6厘米以内，使中心磁场强度达到一定水平，才会有理想的磁化效果。
使用磁化杯还应注意的是，喝水时要一口一口地慢慢喝，细细品味，这样磁化水才会被身体组织的细胞所吸收，达到身体保健的作用。
