众人吹捧的时间一长，禹作敏越来越觉得自己无所不能，直到有一天，他在回答记者的提问时，不再提那句“我就是个农民”了，而是给自己换了一个称呼，他说：“去了‘土’字，我就是皇帝。”
1992年前后，许多从外地招聘来的人才因忍受不了禹作敏的专横，陆陆续续开始离去，而大邱庄也开始有村民因受到了不公正的待遇四处告状，同时越来越严重的贪污问题也慢慢暴露了出来，这些状况都让禹作敏焦头烂额。
大邱庄第二次发生打死人案件，禹作敏授意非法拘禁办案人员92年年底，大邱庄主要从事农业生产经营的华大集团总经理李凤政因病去世，禹作敏亲自为他操办了隆重的葬礼，葬礼一结束，禹作敏随即宣布了一个让所有人都没想到的决定：撤销华大公司，其所属的分厂又津美、津海、尧舜、万全四个集团接管，同时从这四大集团中抽调人，全面清查原华大公司。
很快，大邱庄总公司的会议室便出现了令人瞠目结舌的一幕：在禹作敏的主持下，总经理禹绍政、副总经理石家明，治保主任周克文用警棍、皮鞭等工具对原华大公司的多人进行了非法刑讯，并且还录了像。
61岁的田宜正就是被非法审讯人之一，他否认自己有贪污问题和作风问题后，就遭到了拳打脚踢，最终因无法忍受，只好按照他们的要求“承认”了自己有问题。此时是12月，田宜正在寒冷中被非法关押了14天。
禹作敏对于打人者不仅没有制止，相反，他还夸赞打人者“勇敢”，奖励了5000元。
12月13日，原华大公司业务员危福合被万全公司经理刘云章带到公司三楼，“审讯”开始后，危福合拒绝承认自己有任何经济问题，十几名打手便对他进行殴打，而且出手很重，不仅用警棍点击，还用皮带抽。“审讯”进行了7个多小时后，危福合已经奄奄一息，打手们这才意识到出大事了，马上把他送到医院，没过一会儿，危福合便抢救无效死亡，身上的伤痕多达380多处。
得知消息后，刘云章慌乱地找到了禹作敏，禹作敏听完后，非常淡定地拨通了静海县公安局的电话，说：“我们这里死了个人，我们正审查他的经济问题时，突然闯进十几个大汉不明原因地把人打死了，你们是不是来个人看看？”
随后刘云章等人伪造了两页危福合承认有经济问题的笔录，并跑到医院找到危福合的遗体岸上指纹，然后又命人清理了殴打现场。
当警方赶到后，经过一番侦查，发现疑点颇多。两天后，天津市公安局为了查明事情真相，派出六名刑侦骨干到大邱庄调查。
禹作敏得知此消息后，非常生气，他认为自己向县公安报案，应该由县公安全权调查，此时市公安派人来，就是故意来找茬的。于是在他的授意下，万全公司的刘永华带人将正在查案的6名刑侦人员全部封锁在办公楼内，断绝了他们与外界的一切联系。警车司机发现势头部队，连忙冲破重重拦截，回去报告。直到第二天，天津市长严令大邱庄放人，禹作敏这才将已经被非法拘禁13小时的6名刑侦人员全部释放。
禹作敏散布谣言，组织村民与警方对抗经过两个月的调查，警方认为在危福合命案中，刘云章、李振彪、刘绍升、阵相歧有重大*人嫌疑，于是天津市公安局向全国发出通缉令，同时组织警力，准备进入大邱庄进行搜捕。
警方考虑到大邱庄内有15支枪、2000发子弹，还有一批猎枪，于是经过一级一级向上级请示得到批准后，于1993年2月17日集合了400名警力到大邱庄外3公里的地方待命。
于是便出现了文章开头的一幕，禹作敏面对前来与他交涉的几位领导，说：“群众们不懂法，我也不懂法，谁也不敢保证会不会发生矛盾冲突，我负不了这个责。”
随后大邱庄内便谣言四起，甚至有人说“有人血洗大邱庄”，整个大邱庄进入了“战时状态”。
第二天禹作敏召开完村民大会后，大邱庄内的秩序彻底乱了，所有前来办案的人员全部受到了阻挠。
禹作敏被判20年，彻底走下神坛鉴于大邱庄内出现的不安定因素，天津市委决定成立工作组，3月10日进驻大邱庄，协助恢复正常生产和生活，同时协助执法机关办案。禹作敏面对工作组，一面口头上表示一定权利配合，一面有私下指使人协助其中一名通缉犯外逃。
最终，警方经过一个多月的努力，查清了危福合命案的全部细节，4月21日，工作人员向禹作敏出示了经天津市检察院批准的逮捕证。
1993年8月，经过天津市中级人民法院公开审理，禹作敏因窝藏罪、妨碍公务罪、非法拘禁罪，行贿罪、非法拘禁罪等，数罪并罚有期徒刑20年。禹作敏当时在法庭上说：“我个人认为既不怨法律观念淡薄。也不怨法律知识浅，包庇犯罪就是一个错误，尤其是大邱庄成为华夏第一村以后。我的头脑膨胀了。”
自从禹作敏被捕后，媒体和学者们不断用各种视角解读禹作敏，大邱庄的故事，有人为那个被打死的年轻会计而谴责他，痛斥他无视生命和法治。也有人将禹作敏的的悲剧归结于他在大邱庄说一不二，缺乏监督。
1998年，禹作敏病重，住进了天津市天和医院3楼甲病房，由于患有精神衰弱症，长期需要服用安眠药。1999年10月2日凌晨，禹作敏因服药量过大引发心脏病而死亡。
一代“传奇”就此落幕……
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