“人类自诞生那一刻起，就一直在思考，我是谁，我来自哪里，我又该往哪里去。”
其实eva纵观全篇一直在提到“人类补完计划”，这个计划其实就是通过死海文书的发现和解读，让人类中一部分人的意识提前“觉醒”了，他们成立了迷之宗教组织Seele（在德语中是“灵魂”之意，这个组织有影射“共济会”的痕迹。）Seele组织认为现在的人类存在背负原罪的，人类的心灵不应该是分布在一个个弱小的个体里，而应该回归到莉莉丝成为一个完整的心灵、一个完整的生命体。完成了这个回归的过程后，人类将洗净身上的罪恶，成功的向上帝赎罪。
回到故事本身eva其实一直想传达的就是人类永远的孤独这一主旨。
主角真嗣是孤独的
，他性格内向，不擅长与人交流。母亲的过早离世，父亲又是个工作狂，从小就缺少家庭的温暖。自身对自己的存在价值持怀疑态度的少年。一直处于被动接受的状态，被离开10年以上的父亲命令，驾驶EVA初号机与使徒作战。在与使徒激烈的战斗中，不断摸索着自己的归宿。他渴望摆脱孤独，在与第十使徒战斗后终于得到父亲的夸奖，他内心也会感到喜悦，住进美里的家以后第一次真切的感受到家庭温暖，真嗣正是一代人的处境之缩影。
绫波丽是孤独的
