BB-34纽约号战列舰
在1941年2月，金梅尔开始接手珍珠港基地，并且担任太平洋舰队总司令，并且被临时升任为海军上将，而金梅尔本人因为其勤奋工作，也受到了下属的好评。要说的是，美国海军中，临时升任的军衔，是和其在海军中的职位相匹配的，而原本的军衔是一种荣誉级别，在战争结束后，一般会将临时军衔收回，但是也不乏因为在战争中指挥得当，将本身的军衔升任到临时军衔那样高的指挥官。例如威廉.哈尔西将军，他在1938年才升任海军少将，但是由于其在1940年开始担任第2航空母舰舰队司令，而获得了海军上将的临时军衔，但哈尔西在二战中的杰出表现，让他原本的军衔，也被提升到了海军上将，以至于五星上将。而哈尔西本人也对金梅尔评价颇高，赞誉他为"这项工作的理想人选"。
金梅尔和肖特将军在珍珠港迎接蒙巴顿的访问
金梅尔在接手珍珠港后，其实早已预感到日本海军对珍珠港的威胁。而且实际上，金梅尔接手的是一个烂摊子，前任珍珠港海军司令官詹姆斯.理查德森十分不重视珍珠港的作用，因为他认为珍珠港很容易受到袭击，虽然在10个月后的珍珠港偷袭中，证明了他的观点。但是理查德森在卸任前，将珍珠港基地的主要装备和资源，包括部份战舰等，还拆除了一部分可以转运到圣迭戈的建筑设备，调到了美国东海岸的圣迭戈海军基地。可以这么说，金梅尔任期内遭到袭击的失利，是必然的。
在1941年2月18日，金梅尔给哈罗德·雷恩斯福德·斯塔克海军上将致函到："我感到有可能日本海军会对珍珠港进行突袭（潜艇，空中或联合攻击），我们正在采取实际的应对方案，以尽量减少造成的损害并确保来袭的敌军会为此付出代价。"
1941年10月份珍珠港的航拍图
在1941年4月18日，金梅尔又给海军作战部长写信，要求增加威克岛地区的海军陆战队的防御水平，向他们提供更多的装备和资源，在后来，第一海军陆战队被调往威克岛。其后，金梅尔又在中途岛修建机场，在机场跑道和其他附属建筑完工后，8月份中途岛海军航空站投入使用。在11月，金梅尔的一项关键指令，扭转了珍珠港事件时美国海军航母舰队的命运，他将企业号航母战斗群派出珍珠港，前往威克岛区域，为威克岛上的驻军增加人数，以及输送飞行员；并且在珍珠港事件发生的前两天，也就是12月5日，命令列克星敦号航空母舰出港，将珍珠港基地的部份俯冲轰炸机送往中途岛。金梅尔这两项命令，直接导致珍珠港遇袭的当天，美国海军没有一艘航空母舰在珍珠港停泊，为美国海军在战争初期保存了航母力量。
