一、消毒
将选好的种蛋用新洁而灭、安力2000等浸泡、消毒、洗涤5分钟，也可用高锰酸钾洗涤消毒。操作人员应戴橡胶手套，防止药物长期作用于皮肤对人体有害。
二、码盘
将消毒后的种蛋小头朝下、 大头朝上，这种放置称码盘。码盘时应气室朝上，防止将破蛋码入盘中。由于芦丁鸡种蛋皮薄易破损，因此应轻拿、轻放，防止损伤蛋壳。
三、照检
用照蛋器在黑暗条件下从蛋的大头透视，挑出裂纹蛋和破蛋，挑出游动气室蛋和气室不在大头的蛋。
四、喷雾消毒
码盘、 照检后的种蛋放置到蛋车上用喷雾器喷雾消毒。使用的消毒药不能对胚胎发育有害。
五、预温
冬季、 早春和晚秋季节， 孵化室外的气温比孵化室内温度低，温差比较大。当从外地或种鸡舍运到孵化室内的种蛋开箱后，种蛋表面会凝结一层细小的水珠，这种现象称出汗。预温就是将种蛋放置在25~ 30C的室内，缓慢升温24小时，使蛋温和室温平衡。未经预温的种蛋人孵后会出汗，使孵化率下降。
六、上蛋
种蛋码盘后将蛋盘放人 蛋盘车上的蛋盘架内，再将蛋车或蛋盘放人孵化器的过程称上蛋。上蛋时应注意的事项如下：
1、计算出壳时间。上蛋后约需 6小时蛋温升至孵化温度，需17~ 18天出壳。出壳或拣雏时间以中午12时至下午2时为宜。这样出壳后，晚上12时以前可以接种完马立克疫苗。接种疫苗后雏鸡放置4~ 6小时老化，第2天清晨发货,可在白天将雏鸡运到目的地。
2、固定好蛋盘，防止脱盘。码盘后的蛋盘要放到蛋盘架上。蛋盘放到蛋盘架上时，用两手的大拇指卡住蛋盘，用两手的食指向外轻拉蛋盘，检查蛋盘是否放置到准确位置。有的蛋盘下面有钉，蛋盘架上有孔，钉与孔是对应的，上蛋时钉应插入到孔内。
3、蛋车推人到孵化器内后与翻蛋装置相嵌合配套，防止损坏翻重系统或蛋车。蛋车要用利车块固定，防止时间长脱车。蛋车推人后关好机门可开机。关好机门开机是为了防止蛋盘限盘高)真龚消毒。 上蛋后将孵化机门、通风口关闭，用高锰酸钾和福尔马林熏蒸消毒30分钟。
