土壤中的钙离子(Ca2 )是作物可以利用的钙元素形式，作物由根部吸收钙离子，提供地上部的茎叶组织利用。不论是动物还是植物，钙离子都是影响生长发育的重要元素。农民朋友常常将产量与氮磷钾肥联想在一起，而忽略了钙肥这个低调的营养素。
作物除了需要氮、磷、钾等主要养分，中量与微量养分例如：钙、镁、铁、锰等也是不可或缺的。中微量元素往往是影响作物口感、风味、品质的关键。
1、钙是细胞壁、膜的组成分。
钙肥是细胞壁内果胶酸钙的成分，因此细胞伸长和分裂，都需要钙肥。钙肥充足便能提高抗病虫害的能力。
钙离子是作物生理重要的调节因子，它能维持细胞膜结构的稳定性，以及和调节细胞膜的通透性。钙离子和镁离子、钾离子在细胞内外的转运，可调整细胞质的酸碱值。保持膜的不分解，防止果实变形衰老。
2、调节细胞的酸碱值
钙可与细胞中的有机酸结合形成难溶性钙盐，防止酸中毒，并调节pH值。
3、调节细胞渗透压(钙与钾调节气孔的开与关)
钙可使细胞的充水度、黏滞性、弹性及渗透性等适合植物的正常生长，保证代谢作用的顺利进行。
4、一些酶和辅酶的活化剂
ATP的水解酶、淀粉酶、琥珀酸脱氨酶以及磷酯的水解酶，需钙才能活化。
5、影响氮素代谢
作物吸收钙肥的同时，也促进了吸收其他养分的能力。由于钙离子能促进固氮菌与作物共生，帮助固氮细菌在豆科植物的根部形成根瘤，获取大气中的氮气，将之转换为植物可利用的形态，促进氮肥吸收。
6、消除土壤中有害离子的危害
消除铵离子过多的危害，加速铵的转化。对于酸性土壤，减缓H 、Al3 的毒害，对于盐碱性土壤，减缓钠离子过多的毒害。
植物根部依赖蒸腾作用的动力，吸收土壤中的钙离子，并运送到需要钙肥的新组织。任何会降低蒸腾速率的条件，像是高湿、低温，都会引起缺钙，即使土壤中的钙含量是充足的。
植物会蒸发水分的部分(新叶、果实)会先表现出缺钙病症，番茄的尸腐病就是典型的钙缺乏。当肥料中的钙少于40-60ppm，或是钾、镁、钠的含量过高时，都可能引起缺钙。
另外强酸性或砂质土，在有机肥施用的少，而化学肥料料施用的多，也会引起缺钙现象发生。
钙缺乏在番茄果实上的病症-尸腐病
作物缺钙表现症状- 表现在新生组织，叶尖、叶缘黄化，窄小畸形成黏连状，展开受阻，叶脉皱摺。
- 植株生长受阻，节间较短，较正常矮小。
- 植株顶芽、侧芽、根尖等分生组织容易腐烂死亡，幼叶捲曲畸形，多缺刻状，或从叶缘开始变黄坏死；果实顶端易出现黑褐色坏死。
- 蔬菜叶焦病、苹果苦痘病、梨的水心病、番茄与辣椒的脐腐病、大白菜和包心菜的干烧心。
