吴茱萸还有助阳止泻的作用，此助阳主要指的是扶助脾阳与肾阳。吴茱萸入脾经、肾经，性温热，能温脾益肾，针对脾肾阳虚所出现的泄泻，尤其是五更泻，吴茱萸乃常用药，经典处方“四神丸”便是治疗五更泻之经方。
吴茱萸辛热燥列，容易耗气动火，不宜大量使用。同时阴虚内热者不宜使用。
《本草衍义》：吴茱萸下气最速，肠虚人服之愈甚。
《本草纲目》：茱萸，辛热能散能温，苦热能燥能坚，故所治之证，皆取其散寒温中，燥湿解郁之功而已。咽喉口舌生疮者，以茱萸末醋调，贴两足心，移夜便愈。其性虽热，而能引热下行，盖亦从治之义，而谓茱萸之性上行不下行者，似不然也。有人治小儿痘疮口噤者，啮茱萸一、二粒抹之即开，亦取其辛散耳。
