古菌介于原核细胞和真核细胞之间，没有细胞核核膜，没有多种细胞器，这些特点和原核细胞时一样的，但是古菌的细胞有DNA重复系列，基因中有内含子，蛋白质的起始氨基酸是甲硫氨酸，RNA聚合酶是多种类型这些特点，又和真核细胞一样，不同于原核细胞。除此外，古菌的核糖体介于原核生物和真核生物之间。
因此，我们可以从进化起源上认为，古菌应该是介于真核生物和原核生物之间的一个新的种类。所以，生物又可以分为原核，古菌，真核三个种类。也是合理的。
综上，其实每个生物本来就绝不相同，甚至相同物种的个体之间，也存在或多或少的差异。根据这些差异或相同点来分类，可以让我们对整个生物学研究体系有一个整体的认识，无论六界分类也好，五界分类，还是三界分类，都有比较让人信服的理由和标准。能自圆其说就是好的分类。
值得一提的是，鸭嘴兽既下蛋，又吃奶，生物学家们伤透脑筋，不知道该把它列入哪一类动物。经过多年的争论不休，最后，只好以毛和奶作为决定分类的依据，将鸭嘴兽列入哺乳类，称它为“卵生哺乳动物”。因为世界上只有哺乳动物有圆的毛(鸟类的羽毛是扁的）和分泌真正的乳汁，而这两个特点鸭嘴兽都具备。
因此，也鼓励大家按照自己的标准对生物分类，一定会非常多的收获~
