甜瓜种皮颜色是重要的园艺性状之一，因为它与类黄酮含量和抗氧化特性有关。虽然甜瓜种皮的颜色因品种而异，但黄色和棕色是最常见的。
棕色种皮比黄色种皮含有相对高的类黄酮。然而，甜瓜种皮颜色的遗传基础仍然未知。
因此，最近旨在剖析种皮颜色遗传基础的研究评估了来自黄色和棕色种皮甜瓜双亲的六代群体。
甜瓜果实硬度是影响贮藏、运输和鲜果消费的重要园艺性状之一。最近对甜瓜栽培品种‘宝瓜’转录组谱的研究提供了与果实硬度相关的甜瓜基因的新信息。
不同甜瓜品种的果梗长度不同。
连接果实和植物体的瓜果蒂决定了果实的外观和质量。因此，了解甜瓜果实花梗长度的遗传基础将有助于未来旨在改善果实品质的育种计划。
最近对甜瓜的全基因组重新测序确定了3号染色体上的一个候选基因，名为CmFpl3.1。
