华南海鲜批发市场关闭，进行整治
一些科学家因此没能从华南海鲜市场成功取样。
管轶称，追溯动物源是个比较复杂的过程，需要规模和体系等科学分析。
中国科学院院士、中国疾病预防控制中心主任高福也表示，"证据确凿，病源非常清晰是野生动物，但由于市场关了，很难了解怎样从动物传到人身上。"
据《科学》网站报道，科研人员仍未弄清武汉华南海鲜市场发挥的作用，只能确定其在早期疫情中"推波助澜"了一把。
多数研究推测称蝙蝠为自然宿主近阶段，科学家围绕2019-nCoV的自然宿主展开了多项研究。
北京大学工学院教授朱怀球团队基于深度学习算法开发的VHP（病毒宿主预测）方法，推测出蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主，水貂可能为病毒传播的中间宿主。
蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主
中科院武汉病毒所石正丽团队在bioRxiv上发表的研究结果指出，与此前在云南中菊头蝠上检测到的蝙蝠冠状病毒RaTG13相比较，2019-nCoV在整个基因组中与其有96.2%的一致性，与SARS冠状病毒有79.5%的一致性，两者相距1100个核苷酸。
2019-nCoV与云南菊头蝠中存在的RaTG13冠状病毒的序列一致性高达96.2%
专家的共识是，这一差异意味着，2019-nCoV从蝙蝠到人之间可能还存在1个或多个中间宿主。
在此之前，据《自然》杂志报道，中科院上海巴斯德研究所研究员崔杰也指出：nCoV-2019是一种哺乳动物病毒，哺乳动物最有可能成为病毒传播者。
同时，中科院上海巴斯德研究所与军事医学研究院的发布的研究显示：nCoV-2019和SARS都是病毒亚组β冠状病毒的一部分，可寄生和感染高等动物，两种病毒的共同祖先与病毒HKU9-1类似。研究团队推测，nCoV-2019自然宿主为蝙蝠。
新型冠状病毒流行源自蛇？一篇发表在Journal of Medical Virology（医学病毒杂志）的论文指出， 2019-nCoV的密码子使用偏好与蛇类似，因此蛇最有可能是携带新型冠状病毒的动物。
科学媒体"知识分子"商周专栏发表文章称："病毒的传递是在哺乳动物之间进行的。但蛇不是。"
不过，这样的消息很快得到了学界的质疑：科学媒体"知识分子"商周专栏发表文章称："此前流行的SARS和MERS病毒的自然宿主均是蝙蝠，通过果子狸和骆驼传染给人，也就是说，病毒的传递是在哺乳动物之间进行的。但蛇不是哺乳动物，而是爬行类。"
穿山甲或为中间宿主2月7日，华南农大召开新闻发布会称，根据从动物和人类身上提取的冠状病毒的基因比较，研究人员已经锁定穿山甲为新型冠状病毒的潜在中间宿主。
