- 炎症性肠病；
- 溃疡性结肠炎；
- 消化不良，或由幽门螺杆菌感染引起的消化性溃疡；
- 肠癌；
- 便秘；
- 克罗恩病；
- 烧心；
- 腹泻；
→促进术后或伤口更快地恢复
菠萝蛋白酶的抗炎特性，使其成为止痛药物，如阿司匹林的绝佳天然替代品。
一项研究评估了，菠萝蛋白酶治疗拔智齿的患者的能力，发现它能够促进伤口愈合，并有助于减轻患者手术后的疼痛和肿胀。
大多数拔智齿的患者，在术后会出现明显的症状，不幸的是，抗生素和止痛药并不总是能有效预防，愈合过程中的感染或其他不适。
在参与该研究的80人中，与开具通用止痛药的对照组相比，那些服用菠萝蛋白酶的人报告说，术后疼痛，肿胀甚至发红显著降低。
→对抗过敏和哮喘
一项研究调查了，菠萝蛋白酶如何影响患有哮喘的小鼠，结果发现，菠萝蛋白酶可以减少过敏性致敏，并阻止影响气道的其他炎症反应的发展。
这些发现表明，这种酶有助于调节整个免疫系统，它可以通过解决根本原因，来帮助预防过敏，和过度敏感的免疫系统。
在研究中观察到，CD11c（ ）树突状细胞，和DC44抗原呈递细胞，在补充菠萝蛋白酶后不会升高，这就是它能够对抗哮喘和过敏的根本原因。
→帮助预防或治疗鼻窦炎
德国科隆大学的研究人员，对12名已经接受过鼻窦手术的患者，进行了三个月的治疗，他们发现了以下菠萝蛋白酶益处：
总症状评分改善，鼻镜总评分改善，整体生活质量提高，没有不良反应报告。
由于手术在治疗鼻窦炎方面通常无效，因此这项研究，为患有慢性鼻窦问题的人带来了很多希望。
→有助于减轻关节疼痛
由于其强大的抗炎和镇痛特性，菠萝蛋白酶非常适合减轻急性或慢性关节疼痛。
《健康与医学替代疗法》杂志发表了一项研究试验，评估了42名患有退行性脊柱，或疼痛性关节疾病的骨关节炎患者。
