（图片来自网络）
直到最近，中国科学院动物研究所詹祥江实验室联合国内外科学家一起，在国际遗传学前沿杂志 Genome Biology 上发表研究论文，才从基因组层次上系统解开了羊驼的身世之谜：你的老爸（祖先）就是骆马（Vicuna）。不过！！历史上还有过一个隔壁“王叔叔”存在，那就是美洲驼（Llama）。
读到这里，大家不仅要问，科学家们又是如何知道的？
首先，科学家们在南美洲安第斯山地区，广泛收集了这四种驼驼们的样品，也就是两个驯化物种（羊驼Alpaca和美洲驼Llama），两个野生物种（原驼Guanaco和骆马Vicuna）。
图1 采样地图
拿到DNA序列之后，做的第一件事儿就是使用系统树构建，描绘了他们之间的进化关系，我们先记为A树。但是，这个A树长得有点奇怪：原驼（Guanaco）和骆马(Vicuna)这两个野生物种分开很久了，这个可以理解，毕竟是两个野生物种。
美洲驼（Llama）是原驼（Guanaco）的后代，这个也没太大争议，之前的研究也比较支持这个结论。
但是，但是！羊驼却比骆马（Vicuna）的进化关系更久远，看着好像是骆马（Vicuna）是从羊驼里驯化出来的一样。这在逻辑上是说不通的：野生物种怎么会是驯化物种的后代？
图2 系统发生树构建
于是，科学家们又做了一个遗传结构的分析，计算了他们每个个体的祖先成分比例，这才找到原因。
原来羊驼（Alpaca）的DNA成分里，有36%左右是从美洲驼（Llama）渗入过来的，这样就很可能造成羊驼（Alpaca）和美洲驼（Llama）在A树上更靠近一些，让人觉得骆马（Vicuna）是从羊驼（Alpaca）里驯化出来的假象。
图3 遗传结构分析
那么，大家会想，假如把这些渗入过来的DNA片段都去掉，是不是就正常了？
科学家们其实也是这么想的……
因此，科学家们通过“局部祖先推断”的操作，又进一步将这些DNA片段屏蔽掉之后，发现果然正常了！
