你敢信佐助的万花筒刚开眼没多久视力就已经开始下降了，此时的鹰小队正在修养，突然香磷感知到外面有查克拉反应推测应该是被跟踪了。是的没错，跟踪他们的正是云忍村的忍者。光头哥暗中观察了一会后就放出一只蜥蜴回去送情报，结果却被佐助给一剑扎死，见光头知道自己要交代在这里了。
画面一转在雷之国，雷影派出了一个小队前往木叶要求召开针对晓组织的五影会谈。不久后他们从光头哥之前传回的情报推测出了佐助他们的动向，随即便派出了一只小队。但是这只小队来到这里后，佐助他们早就已经不在了，迎接他们的只是光头哥的尸体。
另一边鸣人的修行仍在继续，要在不借助蛤蟆油的情况下感知并控制自然能量的修炼。这一不用蛤蟆油难度瞬间上升了不少。稍微动一点鸣人就开始变蛤蟆了，于是深作就让他在山顶上用一块石板来坐禅，只要稍微精神不集中就会从上面摔下来，这下就是难上加难了。
鸣人坐上去根本坐不稳，直接就从上面掉了下去，好在有深作能及时抓住他。深作告诉鸣人要找到能够掌握平衡的点，然后静止不动，与自然协调，着重强调关键是一动不能动。这个修炼方法自来也之前也经历过，并且最后很好的完成了修行。得知这是自来也也完成过的修行，鸣人表示自己也必须要加油了。随即就分出两个分身继续开始了修炼。
经过了一段艰苦的过程之后鸣人成功的完成了修炼，伴随着自然能量不断汇入体内，他的脸上出现了成为仙人证明的脸谱，而身体则没有一点变成蛤蟆。见状深作不禁感慨道：鸣人已经超越了自来也。仙人模式完成后深作又开始传授鸣人蛙组手，然后就又是一段辛苦的修炼。
鸣人白天和深作进行着对打修行，到了晚上还一个人偷偷的溜了出去，好像在研究着什么东西而且貌似还成功了。
不久后，鸣人所有的修炼基本完成，休息的时候深作告诉他仙人模式存在着某种风险，首先它最多只能维持5分钟，然后为了维持仙人模式，吸收自然能量的时候还不能动，也就是说一旦战斗开始就无法使用了。因此仙人模式只有在有同伴并且能让自己脱身的时候才能使用。
不过问题不大，深作正好可以弥补这个风险。由他站在鸣人的肩膀上，在鸣人战斗的时候他则负责吸取自然能量，这样问题就迎刃而解了。于是他俩就开始了这方面的修炼，但是试了几次都不行。只要一开始深作就莫名其妙的被弹飞了，原来是鸣人肚子里的九尾不乐意。而就在鸣人他们修炼着的时候木叶村即将迎来毁灭性的灾难。
在木叶村外几个木叶的忍者刚准备下班，突然遭到了佩恩的袭击。解决掉他们后小南和其他几个佩恩也赶了过来。他们此次行动分为佯攻和搜寻两路，由修罗道、畜生道和恶鬼道负责佯攻。剩下的人则负责搜寻鸣人的下落。
