首先是黄延秋第一次的离奇失踪后，本来是错发到邻村的电报，变成了由村长接到，并确认时间是黄延秋失踪的第二天。
《人间》节目组也试图想要找到这张电报，但是因为时间太久，没有留存下来。而且黄延秋确认自己在南京的理由是，他看到的是南京的车站、商店。
黄延秋第二次离奇失踪后，说是那两个人带着他找吕海生，门卫对他们一点反应都没有。这次失踪的当夜，黄延秋就请求吕海生给老家拍封电报报平安。当时的村长称在第二天早上十点，就收到了电报。
而传递电报的邮递员也记得这个事情，声称也确实是黄延秋失踪的第二天收到了电报。
而黄延秋的第三次离奇失踪后，他声称自己在北京看过《逼上梁山》的戏，节目中找到了那份报纸，也确实如黄延秋所说。
《人间》这档节目总体来说做得还是比较含糊的，最后也没有给出一个确定的结论，而黄延秋则在节目中意有所指地指出，自己身体很健康，精神也没有问题。
导致后来知道黄延秋事件的人们争执越发尖锐，后续也有不少人撰写此类相关文章，试图探寻事情的真相。
一直以来，黄延秋引起争议的主要是以下几个矛盾点。认为这件事情真实发生的人，首先认为，黄延秋是一个普通农民，文化不高，本质还是比较淳朴，在节目中看起来也十分老实。
他也从未接触过UFO，之前也没有听说过这么离奇的事情，不存在编造的可能。同时他还因为这件事情失去了婚姻。对他来说这件事情是不利的。
其次，当时的交通并不如现在那么便捷。从黄延秋家乡到上海或南京，都需要至少2-3天的时间。
而且，在当时坐火车时需要有介绍信，而且火车票的费用也不便宜。黄延秋在没有介绍信的情况下，断然没有可能前往远在千里之外的上海。
最后，还有人力争这件事情的真实发生，因为海生是住在部队大院，出入门禁十分严格。
虽然《人间》和《走近科学》的说法稍有出入，但是都证明了黄延秋确实直接找到了吕海生。
但是对于以上疑点，都有人提出了有力的反驳言论。第一点是，黄延秋确实看起来非常老实本分，但是不代表他不想到大城市里去。同时这些也不能代表黄延秋对自己的未婚妻满意。
事实上，吕海生曾经在节目中说过的一段话，证明了黄延秋其实是有动机做这些事情的，当时有很多人希望能够进城。而且，第一次由上海遣送站发出的电报上，黄延秋还填错了地址。
