其实这个问题现在就可以回答，碇真嗣最后选择的不是别人，就是明日香，无论是旧剧场版还是新剧场版，新剧场版过于明显所以不多说，咱们今天就来说一说老版的TV和剧场版。
旧剧场版。
碇真嗣究竟喜不喜欢明日香呢？答案是非常喜欢，甚至可以说是到了一见钟情的地步。为什么这么说呢？咱们可以回忆一下第九集，第九集的标题是《瞬间，心灵重叠》这一集的主角自不必多说，那肯定是碇真嗣和明日香两个人，咱们再联系一下标题，其实到这里也大概就能猜出碇真嗣和明日香两个人的设定关系了。而在这一集中，真嗣主动做出了一些之前他从未对其他角色做出的举动，看过老TV的应该都知道，所以就不多说了，能到这一步我们可以发现一点，明日香对真嗣其实是有吸引力的，这种吸引力很明显是和男女之间的感情有关的。
这俩人的感情再明显不过了。
所以我们可以说，明日香一出场就吸引了碇真嗣，无论是绫波丽还是葛城美里都没能做到这一点。
而至少到第10集三人泡温泉之前，明日香自己反倒没有对碇真嗣产生什么感情，对她来说，碇真嗣此时是一个比较靠谱，但却非常软弱的室友而已，一直到初号机跳入岩浆的那一刻，明日香才真正对碇真嗣产生了好感。到第12集，明日香、碇真嗣、绫波丽三人前往基地的路上，看这三个人的表现就会发现一点：明日香和碇真嗣之间的距离越来越近。
碇真嗣。
第15集是明日香碇真嗣二人关系之间的一个转折点，大概在这一集的不久之前，明日香应该是在心里做出了选择：她放弃了自己之前倾慕的加持良介，或者说她真正意识到了，自己并不是真正喜欢加持这位老帅哥。赴游乐园之约只是给好友洞木光一个面子而已，她提前溜出游乐园实际上就是给了碇真嗣第一次在心灵上接近她的机会。我们可以发现在这一集之中明日香对于碇真嗣的态度改变了许多，她脱下鞋之后，就站在客厅入口静静地听完了碇真嗣的独奏，并且夸赞了他。而迟钝的真嗣一直到天色完全暗下来也没有察觉到明日香的变化，直到明日香自己向真嗣开口。然而，我们的真嗣实在是迟钝到极点，就是这种完全的明示，他也没有把握住机会，当然了，也有可能是不敢。
从15集之后，明日香发生了一些很明显的变化，她在很多场合频频提到真嗣，比如第16集在更衣室自言自语“无敌的真嗣大人”第19集被力天使击溃之前反复复读“没有真嗣大人在，我也能打倒使徒！”
