大搞肃清，*人如麻
1946年3月，徐远举成为该署第二处少将处长。李公朴和闻一多两位爱国人士相继被特务暗*。8月份，成都各界人士召开追悼大会时，徐远举策划军统和中统派特务占领会场四周，阻止群众入场；另派督察长许乾刚以维护治安为名，率领武装警察满布会场内外，掩护特务暴行，使追悼大会无法举行。他还命令使用西红柿和墨水瓶将民盟主席张澜头部击伤。
1947年2月下旬，国共和谈宣告破裂。徐派遣大量军警宪特于2月27日晚上3点冲进化龙桥红岩村拘押了中共代表团，查封了中共驻渝办事处和德兴里《新华日报》编辑部、《民主报》、新华书店。并将中共办事处150余人集中到红岩村临时集中营，最后用飞机强行遣送回延安。
1947年春，西南地区工人罢工、学生罢课。5月20日，徐远举接到指示，开始对工人、爱国学生及民主党派人士进行大规模逮捕和整肃。他迅速列出了500余人的黑名单。6月1日起，徐远举率领军警宪特逮捕了300多人，其中在重庆就逮捕了200多人。遗憾的是，在这过程中有10多人遭到了不幸遇害。
1947年冬，共产党员陈尧楷、徐相应在大竹、邻水起义。西南长官公署派整编七十九师一个整编旅前往清剿。为了搜捕中共地下党组织，徐远举派遣二处特务雷天元、张界前往梁山“协剿”，搜集相关资料。
