《蝴蝶公墓》讲述了一个神秘家族的惊天秘密，女主小蝶刚毕业在孤儿院义务教育时碰到了小叶，两人相爱，但没过多久，小叶就突然失踪了。
五年后，小蝶做了一个舞者，又一次演出在舞台上晕倒了，醒来时她的经纪人告诉她，匈牙利有个公司需要个领舞，于是小蝶就来到了匈牙利。这个公司是一个从事医疗和慈善的公司，家族的人住在非常豪华的庄园。并且有个家族墓园但不对外开放。小蝶和其他的舞者在这住下了，傍晚小蝶和其他舞者受到了很多蝴蝶的攻击。
第二天众人参加舞会，小蝶发现跟她伴舞的大少爷很像消失的男友，小蝶去查阅这个公司的资料才发现这个医院私下进行人体实验并被发现过半人半蝶的怪物。庄园里有一个舞者被发现死在了温泉里。这个家族的人把她埋在了后面的墓园里，小蝶发现，墓碑上男人寿命都很短。
小蝶的经纪人打来电话告诉他这个大少爷就是小叶，小蝶跑去找大少爷，大少爷承认了自己就是小叶，但自己中了蝶毒才离开她的，大少爷要小蝶先回国，小蝶答应了，在离开的车上被迷药迷晕，醒来时发现自己在一个大的公墓里，还发现和自己同来的舞者小曼也在这，小曼从小就被注射了蝶毒，并能长出蝴蝶翅膀。小曼长出了蝴蝶翅膀把小蝶打晕，再醒来时已经在手术台上了，原来小蝶身体里有治疗蝶毒的解药，于是小蝶被注射了蝶毒。
变异后的血液用来拯救这个家族的人，后来这个庄园的女主人出现了，N年以前这个公司研究治疗战争时受到生化病毒的人，但实验失败，导致这个家族的人中了蝶毒，男人寿命变得很短，但女人却活很久。在一系列争斗后，心灰意冷的女主人启动了公墓的自毁程序，只有小蝶和小叶逃了出来，然后过上了没羞没臊的日子。
