当然，在考古发掘的过程中，研究者也发现，良渚文明拥有着非常发达的农业，同时拥有着自己的文字，还拥有着非常先进的生产、制作工艺，并且社会阶级分明，已经具备了“文明古国”的形态，算得上是我国长江流域的“文明曙光”。
那么，既然已经找到了大量良渚文明的存在证据，而且对于当时的良渚文明，也有了一个比较系统的了解，为何西方研究者却质疑良渚文明不存在，认为是我国考古界在“造假”呢？这个问题又出在哪里？
简单来说，就是虽然良渚文明的考古发掘，不断有新的发展，并且震惊世界，但是，对于它究竟是否属于“文明古国”，到底算不算得上是“文明”，还具有很大的争议。
所以，在良渚文明的古城遗址没有被彻底发现之前，事实上，西方学者曾经一度认为，所谓的良渚文明，可能只是一个农业发展比较快的小部落，一直到2007年，一座占地面积达到了290万平方米的古城遗址被发现之后，再加上随后的研究，西方学者才终于承认了良渚文明的存在。
如今，国际上已经不否认良渚文明的存在了，但是，至于它为何会在4000年前突然消失，却也仍然存在着争议，除了我国研究者之外，西方学者也对此进行研究。
研究发现，良渚文明是突然消失的，简单来说，就是古城突然就被废弃了，这也让良渚文明的去向，显得更为神秘。
在过去，研究者曾经认为，良渚文明的消失，与夏朝文明的崛起有关，认为当夏朝崛起之后，良渚文明和夏朝就形成了一个竞争的关系，最终在经历过战胜之后，夏朝导致了良渚文明的灭亡。
此外，还有研究者认为，良渚文明的神秘消失，有可能与大洪水有关，因为在东西方的传说中，就曾经提到过，4000多年前，地球上曾经出现过一次可怕的大洪水，而在对于良渚文明的遗址研究过程中，研究者也发现，的确存在着“水泡过”的痕迹。
